1 00:00:01,899 --> 00:00:06,639 Vale, pues en este tema, cosas importantes. 2 00:00:08,599 --> 00:00:16,600 Bien, empezábamos con el corte, cómo se cortaban las... cómo se podía cortar el ADN. 3 00:00:17,420 --> 00:00:28,600 Entonces, importante aquí, hay una serie de enzimas que se llaman endonucleasas de restricción o enzimas de restricción que cortan el ADN en puntos determinados. 4 00:00:28,600 --> 00:00:40,659 determinado. Esos puntos se denominan sitios de restricción. Estas endonucleas, estas 5 00:00:40,659 --> 00:00:48,840 enzimas, se obtienen de bacterias o de células prokaryotas. Y acordaros que teníamos varios 6 00:00:48,840 --> 00:00:54,520 tipos. Teníamos las de tipo 1 y tipo 3 y las de tipo 2. Las que nos interesan a nosotros 7 00:00:54,520 --> 00:01:03,159 son las de tipo 2 porque son las que van a cortar de manera consistente, o sea, en el sitio donde a nosotros nos interesa. 8 00:01:03,159 --> 00:01:15,620 En cambio, las de tipo 1 y las de tipo 3 cortaban lejos del sitio de restricción, lejos de donde a nosotros nos interesa que se corte el ADN. 9 00:01:15,620 --> 00:01:29,540 Y ahora, las de tipo 2 necesitaban magnesio como cofactor. Acordaros que algunas enzimas necesitan de un cofactor para poder actuar y, bueno, que no necesitan energía. 10 00:01:29,540 --> 00:01:54,040 Ahora, estas endonucleasas, importante también, cortan en secuencias palindrómicas, acordaros que las secuencias palindrómicas eran aquellas que se leen igual la secuencia del 5' a 3' como la de la cadena complementaria también de 5' a 3'. 11 00:01:54,040 --> 00:02:00,819 Aquí tenemos adenina, timina, citosina, citosina, aquí A, T, C, C, D, ¿vale? Se leen igual. 12 00:02:02,900 --> 00:02:07,840 Entonces, las endonucleasas de restricción cortan secuencias palindróficas. 13 00:02:08,400 --> 00:02:13,080 Y acordaros que cada enzima de restricción cortaba una secuencia. 14 00:02:14,699 --> 00:02:20,379 Teníamos, por ejemplo, la ECO-R1, ¿vale? Que cortaba, pues bueno, ahora no me acuerdo qué secuencia cortaba, 15 00:02:20,379 --> 00:02:24,400 pero cada una corta en una secuencia determinada. 16 00:02:26,539 --> 00:02:31,400 Cosas importantes también, pues que una vez que la enzima corta, 17 00:02:32,139 --> 00:02:35,780 puede ser que se formen o extremos rumos o extremos cohesivos. 18 00:02:36,500 --> 00:02:42,219 Los extremos rumos son de este tipo, el corte es vertical y no quedan bases desapareadas. 19 00:02:42,780 --> 00:02:48,340 Y en cambio los extremos cohesivos, el corte es de este tipo y sí que quedan bases desapareadas 20 00:02:48,340 --> 00:02:54,319 y por eso se llaman también extremos pegajosos porque luego al quedar bases desapareadas 21 00:02:54,319 --> 00:02:59,620 luego va a ser fácil unir otra vez, puede ser con esta misma cadena o con otra cadena 22 00:02:59,620 --> 00:03:06,099 que se haya cortado con la misma enzima, como por ejemplo cuando se hace al cortar el ADN, 23 00:03:07,039 --> 00:03:09,500 cuando la técnica de ADN es recombinante. 24 00:03:11,539 --> 00:03:16,560 Entonces, importante de aquí, las enzimas cortan enlaces fosfodiéster, ¿vale? 25 00:03:16,560 --> 00:03:44,159 Aquí estamos cortando enlaces, por ejemplo, entre citosina y la guanina. Aquí estamos cortando enlaces fosfodiéster. Y luego había unas enzimas que se llaman las ADN ligasas. Bueno, aquí hablábamos un poco de cómo se nombraban estas enzimas, estas endonucleasas, de la bacteria de la que provenían, etc. 26 00:03:44,159 --> 00:03:51,599 y una vez que está cortado el ADN, pues ahora lo que se puede hacer es unirlo 27 00:03:51,599 --> 00:03:57,939 y veíamos que los extremos cohesivos eran fáciles de unir porque ya tenemos aquí bases desapareadas 28 00:03:57,939 --> 00:04:04,979 y en cambio si se quiere unir extremos romos es más complicado porque aquí no hay bases desapareadas 29 00:04:04,979 --> 00:04:10,240 y entonces lo que se hace es añadir una serie de nucleótidos para que se pueda unir bien 30 00:04:10,240 --> 00:04:17,019 Y ahora la unión va a ser un enlace, se va a formar un enlace fosfo-diéster. 31 00:04:21,829 --> 00:04:24,089 Entonces, esto sería el corte y la unión. 32 00:04:25,569 --> 00:04:27,449 Después teníamos la hibridación. 33 00:04:28,889 --> 00:04:37,329 La hibridación, acordaros, el objetivo de la hibridación es detectar si tenemos una secuencia de ADN determinada. 34 00:04:39,110 --> 00:04:40,889 ¿En qué se basa esta técnica? 35 00:04:40,889 --> 00:05:08,649 Pues se basa en que como el ADN lo podemos desnaturalizar, es decir, abrimos las dos cadenas y ahora lo que hacemos es, en vez de que se unan estas mismas cadenas, 36 00:05:08,649 --> 00:05:14,790 que se han desnaturalizado, que hemos abierto, pues ahora lo que vamos a hacer es añadir una secuencia de ADN 37 00:05:14,790 --> 00:05:20,370 que sea complementaria a una de esas cadenas, a un fragmento de esas cadenas. 38 00:05:20,949 --> 00:05:29,889 Y además, esa secuencia de ADN que añadimos va a estar marcada, se llama sonda y está marcada con un fluoróforo, por ejemplo. 39 00:05:29,889 --> 00:05:46,129 Entonces cuando se una la cadena de ADN que teníamos con el fragmento de ADN que estamos añadiendo, si son complementarias se van a hibridar, se van a unir y eso lo vamos a poder detectar después. 40 00:05:46,129 --> 00:06:10,949 Y acordaros que teníamos varios tipos. Era la SAUDEN, que era con fragmentos de ADN. Luego teníamos la NORDEN, que era añadir ARN. Lo que hacíamos era hibridar fragmentos de ARN. 41 00:06:10,949 --> 00:06:31,649 ARN y aquí lo único, una diferencia aquí en la SAUDEN, primero teníamos que cortar el ADN y sin embargo en la NORDEN con el ARN no hace falta cortarlo porque es una cadena más corta, pero luego el procedimiento era el mismo. 42 00:06:31,649 --> 00:06:56,519 Y después teníamos la misma técnica pero que se hacía in situ, no hace falta extraer el ADN. Esto era la hibridación. Después teníamos la secuenciación, conocer los nucleótidos que forman el ADN y el orden de estos nucleótidos. 43 00:06:56,519 --> 00:07:04,600 Esto ha tenido mucha importancia para conocer el genoma humano, el proyecto del genoma humano. 44 00:07:05,680 --> 00:07:13,519 Y acordaros aquí, la técnica que se utiliza, la que es un poco más sencilla, es la técnica Sanger. 45 00:07:15,339 --> 00:07:25,879 Acordaros que aquí teníamos cuatro tubos y que, importante aquí, en cada uno de ellos poníamos un didesoxirribonucleico. 46 00:07:26,519 --> 00:07:40,839 Tridesoxinucleótido trifosfato, ¿vale? Bueno, da una adenina, acordaros que no tenía OHs y que por lo tanto no puede continuar copiándose la cadena. 47 00:07:40,839 --> 00:07:57,839 Y acordaros que luego se hacía una electroforesis y que a partir de la electroforesis se puede deducir cuál es la secuencia de nucleótidos del ADN que estamos analizando. 48 00:07:57,839 --> 00:08:24,839 Entonces, importante de aquí es lo que se utiliza, aparte de, o sea, es como copiar la cadena de ADN, lo que pasa, si eso se copia con la ADN polimerasa, necesitamos también un cebador, necesitamos también los cuatro nucleótidos, los de siempre, los normales, pero luego necesitamos otros cuatro nucleótidos que no tengan OH en la pentosa, en el grupo azúcar. 49 00:08:24,839 --> 00:08:37,399 Y en cada tubo de estos se añadía aquí la adenina sin la didesoxi, aquí la timina, la citosina, la guanina, en cada uno de ellos uno diferente. 50 00:08:38,740 --> 00:08:40,559 Esta es la técnica Sanford. 51 00:08:40,559 --> 00:09:01,740 Y luego teníamos ya unas técnicas más actuales de secuenciación, que ya eran con reactivos fluorescentes y ya no hacía falta poner cuatro tubos, en un mismo tubo ya se conseguía analizar. 52 00:09:01,740 --> 00:09:04,960 la de la técnica Sanger 53 00:09:04,960 --> 00:09:08,799 luego teníamos la PCR 54 00:09:08,799 --> 00:09:10,080 bueno, vamos a ver primero 55 00:09:10,080 --> 00:09:12,519 la clonación 56 00:09:12,519 --> 00:09:14,480 la del ADN recombinante 57 00:09:14,480 --> 00:09:15,580 y luego volvemos aquí 58 00:09:15,580 --> 00:09:19,620 vale, aquí 59 00:09:19,620 --> 00:09:25,519 la clonación, la técnica del ADN recombinante 60 00:09:25,519 --> 00:09:26,019 acordaros 61 00:09:26,019 --> 00:09:28,620 en esta técnica es una técnica 62 00:09:28,620 --> 00:09:30,460 de clonación celular 63 00:09:30,460 --> 00:09:32,279 es clonación celular porque 64 00:09:32,279 --> 00:09:34,419 estamos utilizando células 65 00:09:34,419 --> 00:09:36,320 en la PCR 66 00:09:36,320 --> 00:09:42,919 es una clonación a celular y ahora qué es lo que se pretende con esta técnica 67 00:09:42,919 --> 00:09:50,320 pues obtener grandes cantidades de un fragmento de adn que sabemos que 68 00:09:50,320 --> 00:09:55,580 codifica a una proteína que a nosotros nos interesa obtener mucha cantidad de 69 00:09:55,580 --> 00:10:02,320 esa proteína puede ser la insulina la hormona del crecimiento o cualquier otra 70 00:10:02,320 --> 00:10:10,379 proteína. Entonces, ¿cómo hacíamos? Lo que hacíamos era cortar el fragmento de ADN 71 00:10:10,379 --> 00:10:17,980 que nosotros sabemos que codifica esa proteína y utilizábamos un vector de clonación. 72 00:10:19,220 --> 00:10:24,379 ¿Os acordáis? Lo que tenemos que cortar con las mismas endonucleasas de restricción. 73 00:10:24,379 --> 00:10:36,919 Y luego lo que hacíamos era unir estos dos fragmentos, el fragmento de ADN que habíamos cortado con nuestro vector de clonación. 74 00:10:38,500 --> 00:10:45,580 Uníamos y aquí ya tenemos el ADN recombinante, porque son los dos fragmentos de ADN. 75 00:10:46,200 --> 00:10:52,679 Y luego lo que hacíamos era insertar este ADN recombinante en una célula y hacer que creciera. 76 00:10:52,679 --> 00:11:10,240 Ahora, cosas importantes de aquí, pues cómo eran los vectores de clonación, cómo tenían que tener una secuencia para que se puedan replicar por sí mismos, cómo tenían que tener también alguna secuencia. 77 00:11:10,240 --> 00:11:35,070 Si os fijáis aquí en esta gráfica de la derecha, aquí teníamos también secuencias donde pueden cortar las endonucleasas. Por ejemplo, aquí cortaría la eco R1, aquí cortaría otra endonucleasa. 78 00:11:35,070 --> 00:11:40,649 Entonces tenemos diferentes secuencias donde pueden cortar las enzimas de restricción. 79 00:11:41,450 --> 00:11:53,809 Importante también, estos vectores tienen que tener una secuencia que nos sirva para luego identificar si el plasmio se ha introducido en la célula o no. 80 00:11:54,909 --> 00:12:01,350 Y esas secuencias normalmente son secuencias que tienen resistencia a antibióticos. 81 00:12:01,350 --> 00:12:07,649 O sea, son marcadores que son genes que dan resistencia a antibióticos. 82 00:12:09,409 --> 00:12:14,350 Bueno, normalmente el más típico vector de clonación son los plásmidos, 83 00:12:15,710 --> 00:12:21,649 luego teníamos los bacteriófagos, los cósmidos, los BAC, los JAK. 84 00:12:25,129 --> 00:12:31,269 Y ahora lo que hacíamos era introducir ese ADN recombinante en la célula hospedadora. 85 00:12:31,269 --> 00:12:35,789 Acordaros también que las células tenían que tener una serie de características. 86 00:12:37,250 --> 00:12:50,690 Y por último, tenemos que comprobar si esa célula hospedadora tiene el plasmido. 87 00:12:55,240 --> 00:13:01,919 Primero tenemos que identificar si esas células han adquirido el plasmido. 88 00:13:01,919 --> 00:13:25,820 ¿Cómo se hace eso? Pues se pone el cultivo en un antibiótico. Ahora, si está el plásmido, como este plásmido tiene resistencia a los antibióticos, pues crecerán esas bacterias, pero si no tiene el plásmido, pues esas bacterias no van a crecer. 89 00:13:25,820 --> 00:13:47,470 A ver, voy a buscar a ver si eso está, si lo teníamos por aquí. Bueno, eso es, primero identificamos aquí, identificamos las bacterias que tengan el plásmido, entonces ponemos en antibiótico, pues solamente van a crecer esta de aquí de la izquierda, esta que tiene el plásmido. 90 00:13:47,470 --> 00:14:10,960 Y lo siguiente que tenemos que ver es que si esas bacterias, además de, o sea, si tienen el ADN recombinante y para ello había otra forma que era, vale, a ver dónde está esto, aquí. 91 00:14:10,960 --> 00:14:32,559 Entonces, para ver si la célula se ha modificado, o sea, si contiene el ADN recombinante, lo que hacíamos era romper aquí este gen en el plásmido, que este gen codifica a proteínas que tienen color azul. 92 00:14:32,559 --> 00:14:51,320 Por lo tanto, si introducimos aquí, si rompemos aquí esta secuencia, este gen, e introducimos aquí nuestro fragmento de ADN de interés, pues se va a romper este gen y ya no se nos van a formar células de color azul, sino que se nos van a formar células de color blanco. 93 00:14:51,320 --> 00:15:03,259 Entonces, primero identificar si la célula contiene el plásmido y segundo identificar si realmente tenemos el ADN recombinante o solamente tenemos el plásmido 94 00:15:03,259 --> 00:15:20,679 Y otra cosa aquí que se me ha olvidado deciros, cómo se transformaban las células, que podía ser por competencia natural, por competencia artificial o por electroporación 95 00:15:27,559 --> 00:15:52,059 Bueno, estos eran los hospedadores, los eucarióticos y algunas aplicaciones del ADN recuminante. Y ahora volvemos a la PCR. 96 00:15:52,059 --> 00:16:23,059 Bueno, la PCR. Importante lo que significa la sigla PCR, de reacción en cadena de la polimerasa. Importante también las etapas, la desnaturalización, es decir, que se rompen los puentes de hidrógeno entre las bases nitrogenadas. 97 00:16:23,059 --> 00:16:44,779 La hibridación, aquí se necesitan dos primers, estos dos primers son los que delimitan el fragmento que se va a copiar y ahora una vez que ya están los primers, la etapa de elongación, es decir, la ADN polimerasa empieza a copiar esas dos cadenas. 98 00:16:44,779 --> 00:17:06,400 Ahora, otra cosa importante. Estas tres etapas se repiten cíclicamente entre 20 y 40 veces. Acordaos de cuando pusimos en las prácticas y se van aumentando exponencialmente las cadenas de ADN. 99 00:17:06,400 --> 00:17:22,119 Y acordaros también de los componentes de la PCR. ¿Qué necesitamos? Pues el ADN que se quiere copiar. Bueno, importante, perdón, antes de esto, el objetivo de la PCR. 100 00:17:22,119 --> 00:17:44,319 El objetivo es obtener muchas copias de un fragmento de ADN partiendo de un mínimo. Aquí lo que os decía antes, aquí en este caso es una clonación acelular, porque aquí no tenemos ninguna célula, es una clonación acelular. 101 00:17:44,319 --> 00:18:06,200 Entonces, esos son los componentes que necesitamos. El ADN molde. Luego, la TAC polimerasa. Acordaros que antiguamente se utilizaba otra enzima pero que no resistía a los cambios de temperatura y en cambio está así. La TAC polimerasa resiste a los cambios de temperatura. 102 00:18:06,839 --> 00:18:09,819 Necesitamos eso, dos primers o cebadores. 103 00:18:11,319 --> 00:18:19,299 Los desoxinucleótidos, para que la ADN polimerasa vaya copiando y vaya cogiendo la adenina, la timina. 104 00:18:20,519 --> 00:18:25,039 También se necesita iones magnesio, dos más, para estimular a la enzima. 105 00:18:25,039 --> 00:18:30,359 Los iones magnesio actúan de cofactor, para que la enzima actúe. 106 00:18:30,359 --> 00:18:45,440 Y luego se necesita también que todo ello hacerlo en una disolución que sea amortiguadora, ¿vale? Porque acordaros que dependiendo del pH las proteínas se pueden desnaturalizar. 107 00:18:45,440 --> 00:18:48,720 Y por último se necesita el termociclador. 108 00:18:56,339 --> 00:19:13,980 Entonces, ¿problema de la PCR? Pues que, claro, es una técnica muy sensible, muy sensible que significa que con una mínima cantidad de muestra podemos obtener gran cantidad de copias de ADN. 109 00:19:13,980 --> 00:19:29,940 Pero claro, ¿cuál es el problema? Que si hay una pequeña contaminación, pues puede ser que se nos amplifique un fragmento de ADN que no nos interesa, o sea, que no es el que a nosotros nos interesa. 110 00:19:29,940 --> 00:19:49,660 Por lo tanto, una solución a este problema es la PCR en tiempo real o cuantitativa. Si os acordáis, en esta PCR lo que hacíamos era, los primers estaban marcados con un fluoróforo, es decir, son como una serie de sondas. 111 00:19:49,660 --> 00:19:57,980 y así podíamos ir analizando, cuantificando cómo se va amplificando el ADN 112 00:19:57,980 --> 00:20:05,759 y además así en la PCR normal teníamos que hacer después de la PCR 113 00:20:05,759 --> 00:20:11,359 se hace una electroforesis en gel de agarosa, pues aquí no es necesario hacer la electroforesis. 114 00:20:11,359 --> 00:20:28,980 Vale, y luego teníamos la transcriptasa inversa que es simplemente para que partimos del ADN. 115 00:20:29,759 --> 00:20:34,859 Entonces necesitamos encima que la transcriptasa inversa que sintetice el ADN complementario. 116 00:20:34,859 --> 00:20:46,990 Entonces, ahora quería poneros de la práctica que hicimos. 117 00:21:01,180 --> 00:21:11,289 Esto no está bien preparada la presentación, pero solamente es para repasar lo que hicimos en la práctica. 118 00:21:11,289 --> 00:21:21,529 Entonces, si os acordáis en la práctica que hicimos teníamos cuatro muestras de maíz y queríamos saber cuál era transgénico 119 00:21:21,529 --> 00:21:29,450 En el aula virtual tenéis el protocolo de la práctica que era de la marca de BioT 120 00:21:29,450 --> 00:21:36,230 Y ahí os explica, hay un poco de introducción de teoría de lo que son los transgénicos 121 00:21:36,230 --> 00:21:42,390 O sea, los compuestos transgénicos son aquellos a los que se ha introducido un gen diferente. 122 00:21:43,849 --> 00:21:51,930 Entonces, en esta práctica lo que nos interesaba era saber cuál de estas cuatro muestras de maíz, cuál era transgénico. 123 00:21:53,630 --> 00:21:58,509 ¿Cómo hicimos la práctica? Pues en la primera etapa lo que hicimos fue extraer el ADN. 124 00:21:58,509 --> 00:22:16,250 En esta etapa, esto lo tenéis como se hizo en el protocolo, pero esto no lo tenéis que aprender, solamente eso, saber que extrajimos el, primero había que extraer el ADN, que esto fue lo que nos llevó un día entero. 125 00:22:16,250 --> 00:22:21,349 El siguiente paso que hicimos fue ya hacer la PCR 126 00:22:21,349 --> 00:22:25,769 Entonces en el kit que ya nos ofrecían en BioT 127 00:22:25,769 --> 00:22:30,849 Ya teníamos lo que se llama mix de la PCR 128 00:22:30,849 --> 00:22:36,670 Pues aquí en este mix ya teníamos todos los componentes que acabamos de ver 129 00:22:36,670 --> 00:22:39,230 Ahora los componentes para hacer la PCR 130 00:22:39,230 --> 00:22:43,049 Acordaros que poníamos en el Ependor 131 00:22:43,049 --> 00:22:45,549 Ependor que eran muy pequeños 132 00:22:45,549 --> 00:22:48,569 y que lo poníamos en el termociclador. 133 00:22:49,869 --> 00:22:57,890 Ahora, una cosa importante, aquí está, siempre estamos hablando que en la PCR tenemos dos primers, 134 00:22:57,970 --> 00:23:01,549 que esos dos primers van a amplificar un segmento de ADN. 135 00:23:02,349 --> 00:23:09,950 Pues aquí, en este caso, en esta práctica, lo que tenemos son cuatro primers. 136 00:23:10,930 --> 00:23:16,470 Dos primers van a amplificar regiones de maíz normal, regiones endógenas. 137 00:23:17,529 --> 00:23:24,130 Y ese fragmento, como luego vamos a hacer una electroforesis, pues nos debería aparecer a 226 pares de base. 138 00:23:25,230 --> 00:23:36,130 Y los otros dos primers nos van a amplificar genes foráneos, o sea, nos van a amplificar genes que nos están identificando que tenemos maíz transgénico. 139 00:23:36,130 --> 00:23:43,269 transgénico. Y ese gen foráneo va a ser un fragmento que va a aparecer a 184 pares 140 00:23:43,269 --> 00:23:50,230 de bases cuando hagamos la electroforesis. Entonces tenemos cuatro primers en el mismo 141 00:23:50,230 --> 00:23:58,930 ependor. Dos amplifican a maíz, un gen de maíz normal, endógeno, y otros dos primers 142 00:23:58,930 --> 00:24:03,809 Nos amplifican un gen de maíz transgénico foráneo. 143 00:24:05,960 --> 00:24:17,720 Entonces hicimos la PCR, bueno, pusimos el programa de temperaturas que nos indicaban para hacer las tres etapas 144 00:24:17,720 --> 00:24:23,119 y pusimos, me acuerdo, creo que 25 ciclos, no me acuerdo muy bien. 145 00:24:23,119 --> 00:24:50,720 Ahora, una vez terminada la PCR, lo que tenemos que analizar, tenemos que ver es si hemos amplificado el fragmento de ADN que a nosotros nos interesa y además con la electroforesis vamos a identificar en este caso si tenemos ADN transgénico o no, o sea, perdón, maíz transgénico o no. 146 00:24:50,720 --> 00:25:03,180 Por lo tanto, lo que hicimos luego fue hacer la electroforesis en gel de agarosa, pero para eso tuvimos primero que preparar el gel de agarosa. 147 00:25:04,440 --> 00:25:12,839 ¿Os acordáis? El gel de agarosa lo preparamos disolviendo agarosa en una disolución tampón que se llama tampón TAE. 148 00:25:12,839 --> 00:25:35,240 T-A-E. Entonces, aquí acordaros que teníamos, o sea, había que ver qué tamaño eran nuestras cubetas. Hay diferentes tamaños de cubeta, tenemos 7x7, 7x10 y 15x11. 149 00:25:35,240 --> 00:25:44,619 La que nosotros teníamos era la de 7 por 10 y en esta cubierta caben 60 mililitros de disolución. 150 00:25:45,920 --> 00:25:52,220 Entonces, acordaros que teníamos que disolver la agarosa en el tampón TAE. 151 00:25:52,920 --> 00:25:59,460 Ahora, la disolución de agarosa que se prepara es al 3%. 152 00:25:59,460 --> 00:26:20,119 O sea, que si preparáramos 100 mililitros, pues tendríamos que pesar 3 gramos de agarosa. Pero como nosotros necesitamos 60 mililitros, pues si solo queremos 60 mililitros, tendríamos que calcular cuánta agarosa necesitamos para disolver en esos 60 mililitros. 153 00:26:20,119 --> 00:26:27,859 O sea, 3 gramos de agarosa en 100 mililitros, o sea, 3 gramos dividido entre 100 por 60 mililitros. 154 00:26:30,420 --> 00:26:35,559 ¿Queremos preparar el doble? ¿Por qué queremos hacer dos geles? 155 00:26:35,660 --> 00:26:39,000 Pues serían 3 por 120 partido de 100. 156 00:26:39,700 --> 00:26:43,500 Y los gramos que nos salgan aquí serían los gramos que tenemos que disolver. 157 00:26:43,740 --> 00:26:50,000 Si os acordáis, los disolvíamos, no me acuerdo si utilizamos R. Meyer o una botella, no me acuerdo muy bien. 158 00:26:50,119 --> 00:27:02,940 y lo metíamos en el microondas, luego lo echábamos a la cubeta y colocábamos el peine para que se nos generara cuando se enfríe, que se nos queden los pocillos. 159 00:27:03,819 --> 00:27:06,740 En esos pocillos es donde ya introducíamos nuestra muestra. 160 00:27:06,740 --> 00:27:25,759 Ahora, antes que esto, para preparar, o sea, para disolver el gel de agarosa, perdón, la agarosa se disuelve en disolución tampón TAE, pero tenemos que disolverlo en disolución tampón TAE de 1 por, pero la que teníamos era de 50 por. 161 00:27:25,759 --> 00:27:43,380 Entonces tenemos que hacer los cálculos, esto es la concentración, teníamos que hacer los cálculos para preparar 1 por, entonces esto es por la relación de concentraciones, V1 por C1 igual a V2 por C2, 162 00:27:43,380 --> 00:28:05,039 Pues calculamos qué volumen tenemos que coger de la disolución de 50 por, de la que está más concentrada, o sea, 3 mililitros, tenemos que coger 3 mililitros de la disolución de 50 por y enrasar con agua hasta 150, porque son 150 mililitros los que preparamos en las prácticas. 163 00:28:05,039 --> 00:28:19,339 Si yo os digo, pues vamos a preparar 200 mililitros de disolución tampón TAE, 1 por, ¿cuál volumen tendrías que coger si tenemos de la concentración es 50 por? 164 00:28:19,339 --> 00:28:33,400 Pues sería aquí lo mismo, aquí pondríamos en vez de 150, pondríamos 200 por 1 dividido entre 50, bueno, el 10 a la menos 3 lo podríamos quitar. 165 00:28:35,039 --> 00:28:41,660 vale entonces esto sería eso para preparar el gel de agarosa 166 00:28:41,660 --> 00:28:50,180 y luego ya pondríamos la muestra en los pocillos y si os acordáis pusimos las 167 00:28:50,180 --> 00:28:55,299 cuatro muestras y luego pusimos los controles negativos 168 00:28:55,299 --> 00:29:01,359 y un control positivo no perdón esto está mal es era un control negativo y 169 00:29:01,359 --> 00:29:15,400 y dos positivos. Entonces, el control positivo era una disolución de ADN que lo daban ya en el kit y que es maíz normal. 170 00:29:16,220 --> 00:29:26,240 Y había otro control positivo, vale, esto es positivo, esto de aquí, otro control positivo en el que teníamos la disolución de ADN de maíz transgénico. 171 00:29:26,240 --> 00:29:47,829 Por lo tanto, si os acordáis, pinchábamos las muestras, aplicábamos el campo eléctrico, como el ADN tiene carga negativa se va a desplazar hacia el polo positivo y se van a separar unos fragmentos de ADN de otros por su masa molecular. 172 00:29:47,829 --> 00:30:17,690 Por lo tanto, bueno, aquí no tengo cómo daría en total, ¿no? Pero bueno, para que lo veáis un poco, el control negativo, pues, bueno, perdón, el control positivo, ¿no? Teníamos, a ver, sí, aquí el 2 y el 3 es lo mismo, es control positivo de ADN, o sea, de maíz normal, serían esta el 2 y el 3. 173 00:30:17,829 --> 00:30:38,079 Pues esta solamente nos tiene que dar un fragmento a 226 pares de bases, que es lo que hemos visto antes, que era el principio, aquí, ¿vale? Si es maíz normal nos tiene que salir a 226 y si es transgénico a 184. 174 00:30:38,079 --> 00:30:48,349 Por lo tanto, el maíz normal nos tiene que dar simplemente una banda a 226. 175 00:30:48,809 --> 00:30:56,049 Y el 4 y el 5, que son estos dos, nos van a salir dos bandas, la de 226 y la de 184. 176 00:30:58,230 --> 00:31:08,190 Y ahora, imaginaros que en esta de aquí, que hemos puesto maíz normal, nos hubiera salido otra banda. 177 00:31:09,190 --> 00:31:13,890 ¿Qué nos está diciendo eso? Pues que algo ha fallado en la PCR, hemos debido hacer algo mal, 178 00:31:14,329 --> 00:31:17,289 porque no tiene por qué salir aquí otra banda de maíz transgénico. 179 00:31:18,609 --> 00:31:26,009 Ahora, imaginaros que aquí, en la que hemos puesto ADN transgénico, no nos sale esta banda, la de 184. 180 00:31:26,490 --> 00:31:34,789 ¿Qué nos está indicando esto? Pues también que hemos hecho algo mal de la PCR, o la PCR, o la electroforesis. 181 00:31:34,789 --> 00:31:45,109 Algo ha salido mal, porque aquí no nos está dando banda de 184 de maíz transgénico. Por eso se hacen los controles. 182 00:31:45,109 --> 00:32:07,609 Y luego aquí he puesto esta otra que sería, esto ya son muestras y entonces aquí lo que nos están indicando que la 2, la 4, la 5 y la 7 son maíz transgénico porque nos aparecen dos bandas. 183 00:32:07,609 --> 00:32:11,650 esta sería 226 y esta 184 184 00:32:11,650 --> 00:32:16,349 y en cambio la 3 y la 6 es maíz normal 185 00:32:16,349 --> 00:32:19,430 porque solamente nos aparece una banda 186 00:32:19,430 --> 00:32:26,829 vale, bueno pues esto era lo que quería que vierais 187 00:32:26,829 --> 00:32:36,890 y vale, de esto 188 00:32:36,890 --> 00:32:39,609 de electroforesis en gel de poliaquilamida 189 00:32:39,609 --> 00:32:45,230 mirad también, creo que es en el tema, en la unidad 3 190 00:32:45,230 --> 00:32:49,589 viene también un ejercicio 191 00:32:49,589 --> 00:33:10,789 de, creo que es aquí en esta parte 192 00:33:10,789 --> 00:33:16,190 electrofrenesis 193 00:33:16,190 --> 00:33:20,150 electrofrenesis 194 00:33:20,150 --> 00:33:26,569 bueno, en las videoconferencias 195 00:33:26,569 --> 00:33:30,109 ya os expliqué como se hacía la electrofrenesis 196 00:33:30,109 --> 00:33:35,000 por aquí había un ejercicio 197 00:33:35,000 --> 00:33:36,960 para hacer 198 00:33:36,960 --> 00:33:57,640 pues ahora no lo encuentro 199 00:33:57,640 --> 00:33:58,839 a lo mejor era en el otro 200 00:33:58,839 --> 00:34:01,579 Profe, perdón, quería hacer 201 00:34:01,579 --> 00:34:03,599 una pregunta porque me puede conectar ahorita 202 00:34:03,599 --> 00:34:05,859 pero ya me toca volver a entrar a trabajar 203 00:34:05,859 --> 00:34:06,680 Sí, sí, dime 204 00:34:06,680 --> 00:34:07,440 De cara 205 00:34:07,440 --> 00:34:10,780 al examen como tal 206 00:34:10,780 --> 00:34:13,199 ¿Cómo va a estar? 207 00:34:13,539 --> 00:34:15,019 ¿Cómo va a ser el examen? 208 00:34:15,239 --> 00:34:17,760 ¿Cómo se va a colocar 209 00:34:17,760 --> 00:34:19,860 la parte práctica? ¿Va a poner ejercicio? 210 00:34:20,039 --> 00:34:21,820 ¿Cómo va a ser el examen como tal? 211 00:34:21,880 --> 00:34:22,400 Y perdone 212 00:34:22,400 --> 00:34:24,820 si lo comentó antes porque es que ahorita 213 00:34:24,820 --> 00:34:26,099 fue que me pude conectar 214 00:34:26,099 --> 00:34:28,440 el otro día yo creo que ya 215 00:34:28,440 --> 00:34:30,940 ya lo dije pero no pasa 216 00:34:30,940 --> 00:34:31,239 nada 217 00:34:31,239 --> 00:34:34,679 voy a poneros en el aula virtual 218 00:34:34,679 --> 00:34:35,780 a ver si puedo ir mañana 219 00:34:35,780 --> 00:34:39,059 os pongo por escrito 220 00:34:39,059 --> 00:34:41,019 como va a ser el examen 221 00:34:41,019 --> 00:34:42,920 pero os lo digo también 222 00:34:42,920 --> 00:34:43,960 en principio 223 00:34:43,960 --> 00:34:46,519 todavía no 224 00:34:46,519 --> 00:34:48,360 lo tengo terminado 225 00:34:48,360 --> 00:34:50,960 pero habrá 25 226 00:34:50,960 --> 00:34:53,019 alrededor, de 25 227 00:34:53,019 --> 00:34:55,199 más o menos, preguntas de test 228 00:34:55,199 --> 00:34:56,920 con 4 respuestas 229 00:34:56,920 --> 00:34:57,940 ¿vale? 230 00:34:58,099 --> 00:35:00,960 cada 4 mal restan 231 00:35:00,960 --> 00:35:01,460 una bien 232 00:35:01,460 --> 00:35:07,000 puede que haya también alguna pregunta 233 00:35:07,000 --> 00:35:08,219 de verdadero o falso 234 00:35:08,219 --> 00:35:10,739 y puede que igual haya 235 00:35:10,739 --> 00:35:12,019 alguna pregunta también 236 00:35:12,019 --> 00:35:14,139 de escribir 237 00:35:14,139 --> 00:35:16,679 pero igual, simplemente igual 238 00:35:16,679 --> 00:35:18,360 rellenar una frase 239 00:35:18,360 --> 00:35:19,579 o algo 240 00:35:19,579 --> 00:35:22,599 o escribir una frase pero corta 241 00:35:22,599 --> 00:35:24,320 vale, entonces 242 00:35:24,320 --> 00:35:26,780 las preguntas de test 243 00:35:26,780 --> 00:35:28,579 y bueno, las de verdadero 244 00:35:28,579 --> 00:35:29,780 y falso en general 245 00:35:29,780 --> 00:35:32,199 miraros las 246 00:35:32,199 --> 00:35:34,360 autoevaluaciones que habéis hecho porque serán 247 00:35:34,360 --> 00:35:35,000 de ese estilo 248 00:35:35,000 --> 00:35:38,739 miraros también 249 00:35:38,739 --> 00:35:40,380 lo que os decía 250 00:35:40,380 --> 00:35:42,360 antes, en cada unidad 251 00:35:42,360 --> 00:35:44,280 de trabajo, a lo largo de cada 252 00:35:44,280 --> 00:35:46,440 documento vais teniendo 253 00:35:46,440 --> 00:35:47,880 ahí preguntas 254 00:35:47,880 --> 00:35:51,340 no sé si lo llaman autoevaluación, no sé cómo se llama 255 00:35:51,340 --> 00:35:54,599 pero ahí también tenéis cosillas, miraros eso también 256 00:35:54,599 --> 00:35:55,699 ¿vale? 257 00:35:57,699 --> 00:36:00,280 ¿qué más? luego va a haber 258 00:36:00,280 --> 00:36:02,380 problemas de 259 00:36:02,380 --> 00:36:06,380 la parte de replicación 260 00:36:06,380 --> 00:36:09,360 bueno, más bien de transcripción y de traducción 261 00:36:09,360 --> 00:36:12,039 aquellos problemas que hicimos 262 00:36:12,039 --> 00:36:14,480 pues de esos de 263 00:36:14,480 --> 00:36:24,280 Si tengo la cadena de ARN mensajero, una serie de nucleótidos, ¿qué proteínas se sintetizan? 264 00:36:25,380 --> 00:36:36,860 Yo os daría el código genético y vosotros tenéis que ir cada triplete, pues este metionina, tal, así, de ese estilo de los que hicimos. 265 00:36:36,860 --> 00:36:56,380 De esos ejercicios también había alguno que había algún dibujo que teníais que poner, había uno que era la transcripción o la traducción y teníais que poner cuáles eran los ribosomas, cuáles eran el ARN de transferencia, el aminoácido y eso. 266 00:36:56,380 --> 00:37:10,460 Miraros esos ejercicios. Y después, ¿habrá algún ejercicio que esté más relacionado con lo que se llama supuestos prácticos? 267 00:37:10,460 --> 00:37:18,699 Esos ejercicios, ¿qué puede ser? Pues puede ser una cromatografía en capa fina, por ejemplo 268 00:37:18,699 --> 00:37:23,860 Que eso lo vimos en prácticas y vimos también en la simulación 269 00:37:23,860 --> 00:37:30,260 En una de las videoconferencias hicimos una simulación con el programa este de Biomodel 270 00:37:30,260 --> 00:37:36,579 Puede ser que os pregunte algo también relacionado con la electroforesis en gel de poliacrilamida 271 00:37:36,579 --> 00:37:42,420 Que eso no hemos hecho prácticas, pero sí hicimos una simulación también con un biomóvil. 272 00:37:43,820 --> 00:37:59,960 Puede ser esto último que hemos visto de electroforesis en gel de agarosa, cómo preparar el gel, cómo preparar la disolución TAE, puede ser cómo se hace la PCR. 273 00:37:59,960 --> 00:38:04,000 y pues también podría ser 274 00:38:04,000 --> 00:38:06,099 quizá si os acordáis 275 00:38:06,099 --> 00:38:06,280 de 276 00:38:06,280 --> 00:38:09,380 en la técnica Sanger 277 00:38:09,380 --> 00:38:11,860 que también se pueden identificar 278 00:38:11,860 --> 00:38:13,719 la secuencia de aminoácidos 279 00:38:13,719 --> 00:38:15,260 que hicimos un problema 280 00:38:15,260 --> 00:38:17,539 podría ser eso también 281 00:38:17,539 --> 00:38:19,519 y 282 00:38:19,519 --> 00:38:23,739 pues ahora mismo 283 00:38:23,739 --> 00:38:25,900 no se me ocurre así 284 00:38:25,900 --> 00:38:29,329 así nada más 285 00:38:29,329 --> 00:38:30,349 eso sería 286 00:38:30,349 --> 00:38:33,829 más o menos el examen 287 00:38:33,829 --> 00:38:36,010 Vale, gracias 288 00:38:36,010 --> 00:38:46,449 Y luego 289 00:38:46,449 --> 00:38:49,050 lo que os decía también 290 00:38:49,050 --> 00:38:52,989 la parte, la primera 291 00:38:52,989 --> 00:38:55,010 que es de test y esa parte 292 00:38:55,010 --> 00:38:58,829 eso contará entre un 40 y un 60% 293 00:38:58,829 --> 00:39:00,130 eso todavía no lo tengo 294 00:39:00,130 --> 00:39:02,710 decidido 295 00:39:02,710 --> 00:39:06,889 y bueno, luego 296 00:39:06,889 --> 00:39:12,500 luego tenéis también los que habéis hecho las prácticas 297 00:39:12,500 --> 00:39:14,780 porque eso al final también cuenta 298 00:39:14,780 --> 00:39:22,389 siempre es para subir nota, nunca para bajar 299 00:39:22,389 --> 00:39:28,030 y pues eso más o menos 300 00:39:28,030 --> 00:39:30,090 sería el examen 301 00:39:30,090 --> 00:39:36,309 yo os pondría, os voy a poner también en el documento 302 00:39:36,309 --> 00:39:37,969 este, os voy a poner 303 00:39:37,969 --> 00:39:42,409 bueno, que tenéis que traer calculadora 304 00:39:42,409 --> 00:39:43,250 el DNI 305 00:39:43,250 --> 00:39:46,829 tenéis que ser puntuales 306 00:39:46,829 --> 00:39:47,530 ¿vale? 307 00:39:49,690 --> 00:39:50,769 y bueno, antes de eso 308 00:39:50,769 --> 00:39:52,269 ¿tenéis alguna duda de 309 00:39:52,269 --> 00:39:54,750 de esto 310 00:39:54,750 --> 00:39:57,090 de la parte de teoría 311 00:39:57,090 --> 00:39:58,909 de lo que hemos visto hoy? 312 00:40:01,860 --> 00:40:02,639 ¿alguna otra duda? 313 00:40:02,940 --> 00:40:03,199 así de 314 00:40:03,199 --> 00:40:16,719 no, vale