1
00:00:23,539 --> 00:00:34,000
Pues, vamos a ver esta unidad de trabajo, que es la 5, que nos habla de toxicidad y mutagenicidad.

2
00:00:35,240 --> 00:00:38,299
Bueno, pues vamos a ver qué es esto.

3
00:00:41,539 --> 00:00:50,119
Vale, pues lo primero, un agente tóxico es aquel compuesto que tiene actividad tóxica y que está producida por un ser vivo

4
00:00:50,119 --> 00:00:57,179
y que además da lugar a intoxicaciones que pueden ser de carácter muy grave y de origen alimentario.

5
00:00:58,320 --> 00:01:05,340
Aquí se ha puesto el hongo este, la manita sphaloides, que es el hongo, bueno, se llama hongo de la muerte

6
00:01:05,340 --> 00:01:11,819
porque es el hongo más mortífero del mundo, que es responsable del 90% de las intoxicaciones relacionadas con setas.

7
00:01:13,180 --> 00:01:17,099
Tiene origen en Europa, pero ya se ha extendido por todo el mundo.

8
00:01:17,099 --> 00:01:27,099
Y este hongo lo que tiene es que contiene unas amatoxinas que lo que hacen es impedir que se sinteticen las proteínas.

9
00:01:31,609 --> 00:01:38,090
Los agentes tóxicos pueden ser de dos tipos según su origen.

10
00:01:38,849 --> 00:01:43,010
Pueden ser de origen natural y de origen antropogénico.

11
00:01:43,010 --> 00:01:50,549
Los de origen natural son por ejemplo los vegetales como lo que acabamos de ver.

12
00:01:51,989 --> 00:02:01,010
De origen animal puede ser por ejemplo la tetrodoxina del pez globo y también pueden ser microorganismos,

13
00:02:02,810 --> 00:02:12,129
pueden ser bacterias, por ejemplo la toxina botulínica, pueden ser hongos filamentosos también que son los que producen micotoxinas.

14
00:02:13,009 --> 00:02:26,770
Estos serían los agentes tóxicos naturales. Y después tenemos los agentes tóxicos antropogénicos. Antropogénicos quiere decir que provienen de la acción del hombre.

15
00:02:28,229 --> 00:02:38,770
Y estos agentes tóxicos antropogénicos son contaminantes ambientales que tienen origen en la industria o también puede ser de origen agrícola.

16
00:02:38,770 --> 00:02:51,389
Entonces, pues tenemos, por ejemplo, los PCBs, que son los policlorobiferilos. Casi todos los compuestos que contienen cloro son de este tipo, agentes tóxicos.

17
00:02:51,389 --> 00:03:11,210
Y también tenemos los plaguicidas, los plaguicidas organoclorados. Un ejemplo es este aquí, que es este hexano que tiene seis cloros. Y este es el lindano.

18
00:03:11,210 --> 00:03:37,629
Bueno, en este hay un caso, hubo un caso en Salén de Gallego, en Huesca, en un pueblecito de Huesca, donde había una industria en la que se sintetizaba este compuesto, el lindano, la industria cerro, pero claro, los suelos siguieron estando contaminados.

19
00:03:37,629 --> 00:03:54,870
Y este producto se fue pasando hacia las aguas hasta llegar a las aguas potables, lo que produjo efectos adversos a los ciudadanos de allí, que salen de Gallego.

20
00:03:57,500 --> 00:04:05,259
Esto sería la división de los agentes tóxicos en función de su origen, naturales y antropogénicos.

21
00:04:05,259 --> 00:04:25,300
Ahora, un agente tóxico, no se puede decir que una sustancia tóxica sea tóxica de manera absoluta, sino que el efecto adverso va a depender de la concentración.

22
00:04:25,300 --> 00:04:32,779
Puede ser que el agente tóxico esté a bajas concentraciones y entonces el efecto sea positivo

23
00:04:32,779 --> 00:04:38,939
O que esté a una alta concentración y el efecto va a ser negativo

24
00:04:38,939 --> 00:04:50,160
Dependiendo del agente tóxico, pues tendrá una concentración u otra en la que va a tener efectos adversos o no

25
00:04:50,160 --> 00:05:03,699
Entonces, bueno, la variación del efecto sobre, o sea, de la dosis sobre el efecto, pues, es una variación sigmoidea de este tipo

26
00:05:03,699 --> 00:05:15,240
Entonces, a bajas dosis el efecto es mínimo y el efecto va aumentando hasta que llega a una dosis determinada en que el efecto ya es máximo

27
00:05:15,240 --> 00:05:25,910
Bueno, pues, esos serían los agentes tóxicos

28
00:05:25,910 --> 00:05:39,850
Y ahora tenemos los agentes mutagénicos. Los agentes mutagénicos son los que ejercen su toxicidad sobre el ADN y lo que hacen es cambiar la estructura del ADN.

29
00:05:39,850 --> 00:05:56,870
Lo característico de estos agentes es que no hay un umbral de concentración en el que digamos pues este tiene efectos adversos como al igual que en los agentes tóxicos, sino que aquí la respuesta es positiva o negativa.

30
00:05:56,870 --> 00:06:17,230
O sea, ¿es mutagénico o no es mutagénico? Y un ejemplo de agente mutagénico, ahí tenéis en el recuadro que pone para saber más, ahí tenéis un vídeo que os explica la alteración de la estructura del ADN debido a la radiación ultravioleta.

31
00:06:17,230 --> 00:06:38,810
Y, bueno, así un poco resumido, lo que hace la luz ultravioleta es que cuando tenemos, esto sería la cadena de ADN, y tenemos dos timinas, pues la luz ultravioleta lo que hace es generar enlaces covalentes entre dos timinas que estén consecutivas.

32
00:06:39,670 --> 00:06:44,430
¿Veis? Aquí tenemos dos timinas, pues genera enlaces covalentes entre estas dos timinas.

33
00:06:44,430 --> 00:06:54,410
Este efecto se puede corregir, hay unas enzimas que corrijan este efecto, pero esto es lo que produce la luz ultravioleta.

34
00:06:54,410 --> 00:07:22,110
En cuanto a tipos de compuestos mutagénicos, tenemos en función de su tamaño, pueden provocar mutaciones génicas o puntuales o mutaciones cromosómicas.

35
00:07:22,110 --> 00:07:39,829
Las que vamos a ver son las mutaciones génicas o puntuales. Vamos a centrarnos en estas. Mutaciones cromosómicas son mutaciones que ocurren en los cromosomas. Vamos a ver las génicas o puntuales.

36
00:07:39,829 --> 00:07:47,670
puntuales. Estas mutaciones, hemos dicho que los agentes mutagénicos afectan a la estructura

37
00:07:47,670 --> 00:07:53,829
del ADN. Bueno, estas mutaciones son de pequeño tamaño, solo modifican a unos pocos pares

38
00:07:53,829 --> 00:08:03,829
de bases, son reversibles y pueden ocasionar cambios en los aminoácidos. Si os acordáis

39
00:08:03,829 --> 00:08:20,470
Cuando estudiamos el dogma central de la biología molecular, veíamos que el ADN se replica, luego el ADN se transcribe a ARN mensajero y de ARN mensajero se traduce a proteínas.

40
00:08:20,470 --> 00:08:28,529
Y veíamos que cada tres nucleótidos, o sea, cada triplete, da lugar a un aminoácido.

41
00:08:29,310 --> 00:08:40,090
Bueno, pues vamos a ver cómo si cambiamos uno de los nucleótidos puede dar lugar a un cambio en aminoácidos y eso puede dar lugar a un cambio de proteína.

42
00:08:41,970 --> 00:08:46,230
Entonces, ¿qué posibilidades tenemos de cambio?

43
00:08:46,230 --> 00:08:58,450
Pues puede ser. Aquí tenemos una cadena normal de ADN, citosina, adenina, timina, citosina, adenina, timina, citosina, adenina, timina.

44
00:08:58,649 --> 00:09:00,149
Esta sería la cadena de ADN.

45
00:09:01,269 --> 00:09:06,409
¿Qué puede ocurrir? Puede ocurrir que una de las bases cambie.

46
00:09:07,190 --> 00:09:11,549
Es decir, aquí tenemos adenina, pues se ha convertido en citosina.

47
00:09:12,169 --> 00:09:13,710
Aquí ya se ha producido un cambio.

48
00:09:13,710 --> 00:09:21,730
Otra de las cosas que puede ocurrir es que haya una adición, que se adicione un nucleótido

49
00:09:21,730 --> 00:09:27,809
Aquí tenemos citosina, adenina, timina, citosina, adenina, igual que aquí

50
00:09:27,809 --> 00:09:31,049
Pero aquí ahora se han añadido dos guaninas

51
00:09:31,049 --> 00:09:36,730
Por lo que esto va a producir un cambio en los aminoácidos

52
00:09:36,730 --> 00:09:42,169
Y luego ya continúa, timina, citosina, adenina, timina, ya igual

53
00:09:42,169 --> 00:10:02,350
Aquí se han añadido dos guaninas. Y otra cosa que puede ocurrir es la supresión, que se suprima uno o más bases nitrogenadas. Por ejemplo, aquí se ha suprimido la adenina y la timina.

54
00:10:03,129 --> 00:10:13,110
Si os fijáis aquí hay una citosina, que es esta de aquí, se han suprimido estas dos, la adenina y la timina, y vuelve a haber otra vez una citosina, adenina y timina.

55
00:10:16,730 --> 00:10:23,850
Vamos a ver cómo pueden afectar estos cambios a la síntesis de proteínas.

56
00:10:25,570 --> 00:10:32,570
Bueno, aquí os he puesto el código genético.

57
00:10:32,570 --> 00:10:45,049
Si os acordáis el código genético estaba degenerado y eso significaba que varios tripletes pueden dar lugar al mismo aminoácido.

58
00:10:45,049 --> 00:11:00,909
Por ejemplo aquí si tenemos citosina, uracilo, uracilo, citosina, uracilo, citosina da lugar a la leucina o si tenemos citosina, uracilo, adenina también da lugar a la leucina.

59
00:11:02,570 --> 00:11:12,509
Pues entonces, imaginaros que tenemos esta cadena de ADN, esta cadena de ADN en la que tenemos adenina, guanina, timina.

60
00:11:13,250 --> 00:11:23,250
Este triplete da lugar a la serina, lo buscamos aquí, adenina, guanina, es adenina, guanina, timina.

61
00:11:23,250 --> 00:11:32,750
Bueno, aquí nos faltaría, adenina o anina

62
00:11:32,750 --> 00:11:36,330
Ah, bueno, claro, porque sería adenina o anina, sería uracil

63
00:11:36,330 --> 00:11:45,529
Vale, sí, porque esta es la cadena de ADN

64
00:11:45,529 --> 00:11:54,610
La que va de 3' a 5', pero la de 5' a 3' sería uracilo, citosina, adenina

65
00:11:54,610 --> 00:12:05,470
Vamos a ver, uracilo, uracilo, esto es, uracilo, citosina, adenina y da lugar a la serina.

66
00:12:06,690 --> 00:12:09,629
Vale, tenemos que buscar la cadena, la complementaria.

67
00:12:10,070 --> 00:12:14,269
Este es el ADN, la cadena de ADN original que va de 3' a 5',

68
00:12:14,269 --> 00:12:21,950
nosotros la que tenemos que buscar es la del ARN mensajero que va de 5' a 3' y que se da la complementaria a esta.

69
00:12:21,950 --> 00:12:39,970
La siguiente tenemos citosina, guanina, guanina, o sea que la complementaria será guanina, citosina, citosina, guanina, guanina, citosina, citosina, que da lugar al aminoácido alanina, y así sucesivamente.

70
00:12:39,970 --> 00:13:00,529
Este sería adenina, timina, guanina, o sea que sería la complementaria, sería uracilo, adenina, citosina, o sea, UAC, tenemos aquí tirosina, esta es la tirosina y la siguiente sería la valina.

71
00:13:01,289 --> 00:13:16,629
Ahora, si cambiamos uno de los aminoácidos, cambiamos esta citosina y ponemos aquí, o sea, se ha producido una mutación y esta citosina se ha convertido en timina y esta adenina se ha convertido en guanina.

72
00:13:17,809 --> 00:13:26,409
¿Qué va a ocurrir? Pues bueno, los primeros tres nucleótidos, el primer triplete va a seguir igual, va a dar serina.

73
00:13:26,409 --> 00:13:48,110
Pero ahora, el siguiente triplete, ¿qué pasa? Que tenemos timina, guanina, guanina, que el complementario sería adenina, citosina, citosina, o sea, ACC. Vamos a buscar el ACC. ACC da lugar a treonina. Por lo tanto, ya nos está cambiando este aminoácido, que antes era alanina.

74
00:13:48,110 --> 00:14:12,409
El siguiente triplete va a ser igual, es A, T, G, pues va a dar lugar a la tirosina, pero ahora en el siguiente triplete ha habido otro cambio de un nucleótido, tenemos citosina, guanina, timina, pues el complementario será G, C, A.

75
00:14:12,409 --> 00:14:29,929
Pues GCA da lugar a la alanina. Por lo tanto, esta proteína va a cambiar porque ahora vamos a tener serina, trionina, tirosina y alanina.

76
00:14:29,929 --> 00:14:44,750
Ahora, si estos cambios, como el código genético está degenerado, estos cambios podrían ser que dieran lugar al mismo aminoácido, que dieran lugar a la anina.

77
00:14:45,509 --> 00:14:52,750
Imaginaros que se nos formara GCC, guanina, citosina, guanina.

78
00:14:52,750 --> 00:14:57,690
O sea, que el original, imaginaos que fuera guanina, citosina, uracilo

79
00:14:57,690 --> 00:15:01,769
Y el que se nos genera, o sea, hay un cambio, una mutación

80
00:15:01,769 --> 00:15:06,809
Y se nos genera GCC, guanina, citosina, citosina

81
00:15:06,809 --> 00:15:08,570
Pues los dos darían lugar a la anina

82
00:15:08,570 --> 00:15:12,090
Por lo tanto, pues no habría cambio en la proteína

83
00:15:12,090 --> 00:15:13,970
Aquí tendríamos también a la anina

84
00:15:13,970 --> 00:15:17,730
Vale, esa es una posibilidad

85
00:15:17,730 --> 00:15:30,970
Y luego, aquí en el archivo también tenéis este otro ejemplo. Dice, si tenemos el siguiente fragmento de ADN que tiene una eliminación de la base indicada.

86
00:15:30,970 --> 00:15:34,690
Aquí no está pintado

87
00:15:34,690 --> 00:15:37,990
La que se divina es

88
00:15:37,990 --> 00:15:39,509
Tenemos

89
00:15:39,509 --> 00:15:40,730
EGA

90
00:15:40,730 --> 00:15:42,190
CGG

91
00:15:42,190 --> 00:15:45,129
Y luego es esta C

92
00:15:45,129 --> 00:15:49,370
Esta C es la que se ha

93
00:15:49,370 --> 00:15:50,809
Se ha eliminado

94
00:15:50,809 --> 00:15:53,730
Ha habido una mutación y se ha eliminado esta citosina

95
00:15:53,730 --> 00:15:55,370
Vale, pues entonces

96
00:15:55,370 --> 00:15:56,710
Vamos a buscar lo mismo

97
00:15:56,710 --> 00:15:58,769
Vamos a buscar el complementario

98
00:15:58,769 --> 00:16:11,570
La cadena complementaria, esta sería ARN, por lo tanto acordaros que tenemos que tener uracilo y pues sería, aquí tenemos TGA, pues el complementario sería ACU.

99
00:16:12,210 --> 00:16:26,730
El siguiente GCC, ¿vale? Entonces así vamos buscando en el código genético, vamos buscando cada triplete, vamos buscando qué aminoácido se obtiene.

100
00:16:26,730 --> 00:16:39,409
Entonces aquí tenemos glicina, tirosina, lisina y valina. Ahora, si se produce una supresión de esta citosina, pues ya los aminoácidos siguientes van a cambiar.

101
00:16:39,409 --> 00:17:04,829
Además, aquí sí que tenemos el ACU, el primer triplete, el siguiente GCC, igual que en el anterior, pero ahora ya el siguiente va a ser, como tenemos, este se ha eliminado la citosina, pues el siguiente va a ser GUU, o sea que ya nos ha cambiado y se nos ha formado otro aminoácido, que es la valina.

102
00:17:04,829 --> 00:17:15,529
El siguiente, ya vamos a tener este triplete T-G-T, que el complementario es A-C-A, por lo tanto es treonina.

103
00:17:15,529 --> 00:17:33,849
Y el siguiente que teníamos, C-A-A, C-A-A es este, luego T-G-T es este, T-G-T-A-C-A.

104
00:17:33,849 --> 00:17:55,049
Y luego ya tendríamos TTC, o sea que sería adenina, adenina, guanina, que nos va a dar lugar a la lisina. Por lo tanto, esta mutación sí que va a dar lugar a una proteína diferente, porque se cambian los aminoácidos.

105
00:17:55,049 --> 00:18:13,369
Y una forma de analizar la capacidad mutagénica que tienen diferentes sustancias es mediante el test de AMES.

106
00:18:14,250 --> 00:18:23,130
Y este test lo desarrolló Bruce Ames y le dieron el premio Nobel por ello.

107
00:18:25,890 --> 00:18:30,170
Vamos a ver en qué consiste este test.

108
00:18:31,769 --> 00:18:42,990
Bueno, lo que se utiliza en este test son cepas de salmonella, salmonella tifimurium, son cepas de salmonella que están mutadas,

109
00:18:42,990 --> 00:18:52,970
están mutados su ADN, de tal forma que esta salmonella no puede sintetizar el aminoácido histidina.

110
00:18:52,970 --> 00:19:03,049
es una salmonella que tiene modificado su ADN y por lo tanto no puede sintetizar el aminoácido histirina

111
00:19:03,049 --> 00:19:10,809
por lo que si queremos que produzcan histirina tenemos que poner a estas cepas con histirina en el medio

112
00:19:10,809 --> 00:19:13,509
para que se puedan replicar y crecer

113
00:19:13,509 --> 00:19:36,750
Pero, si a estas cepas de salmonella les añadimos un compuesto que sea mutagénico, pues este compuesto mutagénico lo que puede hacer es que revierte al ADN que sí que puede, que tiene capacidad de sintetizar histidina.

114
00:19:36,750 --> 00:19:47,049
Entonces tenemos salmonella que tiene su ADN mutado, o sea que no puede producir histidina

115
00:19:47,049 --> 00:19:52,089
Y ahora si le añadimos un compuesto que es mutagénico

116
00:19:52,089 --> 00:19:58,710
Este compuesto mutagénico puede hacer que esta salmonella que revierta su mutación

117
00:19:58,710 --> 00:20:04,650
Y que sí que pueda sintetizar histidina, el aminoácido histidina

118
00:20:04,650 --> 00:20:24,019
Y así es como se ensaya si un compuesto tiene capacidad mutagénica. Entonces tenemos la salmonella que está modificada y este sería un ensayo de control.

119
00:20:24,019 --> 00:20:33,019
Y aquí tenemos también la salmonella modificada, o sea, el ADN que está mutado, que no puede sintetizar histidina.

120
00:20:34,559 --> 00:20:43,099
Ahora, a la de arriba le añadimos un mutágeno del que queremos probar si tiene capacidad mutagénica o no.

121
00:20:43,099 --> 00:20:52,500
y ponemos la salmonella, en este caso con el mutágeno, en una placa Petri

122
00:20:52,500 --> 00:20:57,000
y este sería el ensayo de control, el que no tiene mutágeno.

123
00:20:58,099 --> 00:21:00,220
Y lo ponemos en un medio que tiene histidina.

124
00:21:01,140 --> 00:21:02,660
Entonces, ¿qué pasa?

125
00:21:02,660 --> 00:21:15,160
que la salmonella va a crecer, pero una vez que se termine la histidina va a dejar de crecer,

126
00:21:17,180 --> 00:21:24,579
va a dejar de crecer a no ser que en este de aquí arriba que tiene el compuesto mutágeno

127
00:21:24,579 --> 00:21:31,740
y ese mutágeno ha revertido la mutación de la salmonella

128
00:21:31,740 --> 00:21:37,039
y entonces sí que puede, o sea, consigue que la salmonella crezca.

129
00:21:38,359 --> 00:21:43,099
Y en cambio aquí, aquí solamente tenemos la salmonella modificada.

130
00:21:44,359 --> 00:21:52,200
Como esa salmonella mutada, esa salmonella no puede sintetizar histidina, pues no puede crecer.

131
00:21:54,140 --> 00:21:56,799
Vale, os lo repito que es un poco complicado.

132
00:21:56,799 --> 00:22:04,799
En este de aquí arriba tenemos salmonella y tenemos mutágeno, el compuesto mutágeno.

133
00:22:06,539 --> 00:22:19,220
La salmonella que tenemos está mutada, tiene algún gen que hace que no pueda sintetizar histidina.

134
00:22:19,220 --> 00:22:24,700
Entonces, al añadir el mutágeno, el compuesto mutágeno

135
00:22:24,700 --> 00:22:34,240
Lo que ocurre es que el mutágeno hace que ese ADN, ese gen que hacía que no se pudiera producir histidina

136
00:22:34,240 --> 00:22:40,460
Cambia ese gen, revierte y consigue hacer crecer la salmonella

137
00:22:40,460 --> 00:22:45,940
Por lo tanto, este compuesto que hemos añadido aquí tiene capacidad mutagénica

138
00:22:45,940 --> 00:22:49,519
Tiene capacidad de cambiar el ADN

139
00:22:49,519 --> 00:22:56,970
Vale, pues este sería este tema, el tema 5

140
00:22:56,970 --> 00:23:01,809
No sé si tenéis alguna duda de este tema

141
00:23:01,809 --> 00:23:07,509
Este yo creo que es lo más complicado, lo del test de AMES

142
00:23:07,509 --> 00:23:16,670
Vale, pues bueno, ya habéis visto que este tema es cortito

143
00:23:16,670 --> 00:23:54,700
Bueno, vamos a ver ahora lo que os decía, el punto 4 del tema 2 que se nos quedó por ver, la identificación de proteínas.

144
00:24:09,940 --> 00:24:20,029
Bueno, pues vamos a ver este punto y así también hacemos un pequeño repaso de las proteínas.

145
00:24:20,029 --> 00:24:36,490
Si os acordáis las proteínas estaban formadas por aminoácidos y sus aminoácidos estaban unidos por enlaces peptídicos y teníamos varias estructuras primaria, secundaria, terciaria y algunas podían tener esta estructura cuaternaria.

146
00:24:36,490 --> 00:24:42,170
Vimos también cómo se podían extraer estas proteínas, las formas de extracción

147
00:24:42,170 --> 00:24:50,230
Y vimos también cómo se podían cuantificar por el método de Lowry, Bradford, espectrofotométrico

148
00:24:50,230 --> 00:24:53,970
Y luego vimos que estas proteínas también se podían fraccionar

149
00:24:53,970 --> 00:24:57,849
Si os acordáis, diálisis, cromatografía, electroforesis

150
00:24:57,849 --> 00:25:03,369
Pues hoy vamos a ver cómo se pueden identificar estas proteínas

151
00:25:03,369 --> 00:25:13,410
Vale, entonces vamos a ver estos dos métodos, la técnica Malditov y los ensayos inmunológicos.

152
00:25:14,390 --> 00:25:35,109
Vamos a empezar por la técnica Malditov. Bueno, pues esta técnica se basa en la técnica de espectrometría de masas, que seguramente los que hayáis estudiado el módulo de análisis instrumental, a lo mejor lo habéis estudiado ya.

153
00:25:35,109 --> 00:25:40,049
¿Esta técnica de espectrometría de masas en qué consiste?

154
00:25:40,049 --> 00:25:51,509
Así muy brevemente, lo que vamos a hacer es impactar a nuestra molécula orgánica, que aquí la hemos representado como ABC

155
00:25:51,509 --> 00:26:00,829
La impactamos con un chorro de electrones y lo que conseguimos es ionizar nuestra muestra, cargarla positivamente

156
00:26:00,829 --> 00:26:04,269
Y además esto se hace en fase gaseosa

157
00:26:04,269 --> 00:26:20,109
Entonces vamos a obtener iones a partir de moléculas orgánicas. Y además lo que se hace también es fragmentar esta molécula, la vamos a romper en partes, en trocitos y la vamos a fragmentar.

158
00:26:20,109 --> 00:26:33,049
Y ahora, los fragmentos que obtenemos, que serán iones, van a tener diferente masa y carga y se van a detectar estos iones.

159
00:26:34,410 --> 00:26:39,029
Entonces, aquí tenemos un espectro de masas.

160
00:26:39,950 --> 00:26:44,829
Aquí, por ejemplo, tendríamos esta molécula, que es el butano CH3, CH2, CH2, CH3.

161
00:26:44,829 --> 00:27:05,289
Lo que hacemos es impactar esta molécula con un chorro de electrones y además se fragmenta. Si os fijáis aquí tenemos un CH3 con carga positiva, aquí tenemos un CH3CH2 con carga positiva, aquí está toda la molécula con carga positiva.

162
00:27:05,289 --> 00:27:21,369
Entonces, obtenemos distintas fracciones, o sea, distintos iones con distinto tamaño, que luego se separan y lo que nos da es un espectro de masas de este tipo, con estas señales.

163
00:27:21,369 --> 00:27:28,349
Claro, esto lo podemos hacer para moléculas de este tipo, moléculas pequeñas

164
00:27:28,349 --> 00:27:34,450
Pero ahora, si queremos hacer esto mismo, pero analizar proteínas

165
00:27:34,450 --> 00:27:37,470
Proteínas ya sabemos que son macromoléculas

166
00:27:37,470 --> 00:27:42,150
Por lo tanto, imaginaros que aquí, si fragmentamos las proteínas

167
00:27:42,150 --> 00:27:47,230
Pues obtendríamos aquí un montón de señales que sería muy difícil identificar

168
00:27:47,230 --> 00:27:57,049
Pues para eso se elimina ese problema con esta técnica, la técnica MALDI-TOF.

169
00:27:58,369 --> 00:28:07,849
Estas siglas provienen del inglés y MALDI es de Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Mass Spectrometry.

170
00:28:07,849 --> 00:28:17,230
O sea, en español, espectrometría de masas de ionización, distorsión, láser asistida por matriz.

171
00:28:18,049 --> 00:28:21,150
Con esto es con lo que vamos a generar los iones.

172
00:28:21,930 --> 00:28:31,930
Y luego, ¿cómo analizamos los iones? Pues con el Time of Flight, T-O-F, con este sistema, con el TOF.

173
00:28:34,809 --> 00:28:38,410
Aquí os he puesto unos vídeos por si queréis echarles un vistazo.

174
00:28:39,930 --> 00:28:45,950
Vamos a ver entonces qué significa esto de ionización, desorción, láser, asistida por matriz.

175
00:28:48,940 --> 00:28:58,339
Bueno, lo que podemos conseguir con esta técnica es, lo que os decía, ionizar biomoléculas como péptidos y proteínas sin que se produzca la ruptura de los mismos.

176
00:28:59,140 --> 00:29:02,140
Y además también se pueden ionizar moléculas no volátiles.

177
00:29:02,140 --> 00:29:13,799
Si os acordáis, hemos visto que en espectrometría de masas la técnica se hace en fase gas, pues con esta, con la malditoz, se pueden ionizar moléculas no volátiles.

178
00:29:15,000 --> 00:29:17,240
Vamos a ver cómo se logra esto.

179
00:29:19,240 --> 00:29:28,299
Lo que hacemos es poner, tenemos una placa, esta placa suele ser de poliestireno, y en esta placa tenemos muchos pocillos.

180
00:29:28,299 --> 00:29:31,759
Tenemos hasta 96 pocillos, suele ser 96.

181
00:29:32,140 --> 00:29:36,440
Aquí os he puesto como sería uno de estos pocillos.

182
00:29:37,819 --> 00:29:47,359
Bien, pues lo que vamos a hacer es, vamos a poner en uno de estos pocillos, vamos a poner una matriz, que aquí está representada en color violeta.

183
00:29:48,259 --> 00:29:57,319
Y vamos a mezclar esa matriz con nuestra proteína, con la muestra que nosotros queremos analizar, que sería esto de aquí en verde.

184
00:29:57,319 --> 00:30:01,019
la matriz es simplemente

185
00:30:01,019 --> 00:30:05,579
pensaba que lo tenía

186
00:30:05,579 --> 00:30:09,940
la matriz es simplemente un compuesto orgánico

187
00:30:09,940 --> 00:30:14,599
hay varios tipos de matrices

188
00:30:14,599 --> 00:30:18,160
pero es un compuesto orgánico

189
00:30:18,160 --> 00:30:22,960
y lo que se hace es añadir la matriz

190
00:30:22,960 --> 00:30:26,740
junto con nuestra muestra en estos pocillos

191
00:30:26,740 --> 00:30:33,420
y ahora lo que hacemos es hacer incidir en estos pocillos un rayo láser

192
00:30:33,420 --> 00:30:42,019
y con esto que vamos a conseguir que el sólido que tenemos en cada pocillo pase a fase gas,

193
00:30:42,019 --> 00:30:44,420
que esto sería la desorción.

194
00:30:45,339 --> 00:30:50,440
El sólido va a pasar a fase gas y obtendríamos esto de aquí.

195
00:30:50,440 --> 00:31:00,079
al mismo tiempo la matriz se va a cargar positivamente, si veis aquí tenemos cargas positivas

196
00:31:00,079 --> 00:31:10,180
y ahora esta energía que adquiere la matriz la va a pasar a las moléculas de nuestra muestra,

197
00:31:10,180 --> 00:31:17,599
a estas verdes y estas moléculas se van a ionizar, van a adquirir carga positiva,

198
00:31:17,599 --> 00:31:42,720
Lo veis aquí, cargas positivas. Y luego ya estos iones son los que vamos a analizar. Entonces, consiste en irradiar una muestra que está mezclada con una matriz. Al irradiar con un rayo láser, lo que ocurre es que la matriz y la muestra se desorben, o sea, se produce su desorción, pasan a fase gas.

199
00:31:42,720 --> 00:31:52,480
y la matriz se ioniza y a su vez esa energía que adquiere la transmite a nuestras moléculas en verde

200
00:31:52,480 --> 00:31:54,579
que también se van a ionizar.

201
00:31:55,400 --> 00:31:59,180
Y ahora lo que vamos a hacer es separar estos iones, estas cargas positivas

202
00:31:59,180 --> 00:32:03,680
y eso lo separamos con el analizador de tiempo de vuelo, el TOF.

203
00:32:05,200 --> 00:32:11,460
Y así brevemente lo que ocurre es que le vamos a aplicar a estas muestras,

204
00:32:11,460 --> 00:32:21,980
las que tenemos aquí de distinto tamaño, ionizadas, lo que hacemos es aplicarles un campo eléctrico

205
00:32:21,980 --> 00:32:27,420
y lo que hacen es, se van a ir moviendo hasta llegar al detector.

206
00:32:28,559 --> 00:32:34,299
Las de menor masa molecular se van a mover más rápidamente y van a llegar antes al detector

207
00:32:34,299 --> 00:32:40,819
y las de mayor masa molecular van a tardar más en llegar al detector y así es como se detectan.

208
00:32:40,819 --> 00:32:46,039
Por eso se llama tiempo de vuelo, porque van moviéndose por aquí hasta llegar al detector.

209
00:32:48,000 --> 00:32:54,339
Simplemente que os suene, analizador de tiempo de vuelo, time of flight.

210
00:32:58,549 --> 00:33:01,869
Aquí tenemos este vídeo, vamos a verlo un poquito.

211
00:33:22,019 --> 00:33:24,980
Solamente un poquito para que veáis cómo es la técnica.

212
00:33:30,500 --> 00:33:40,519
Aquí tenemos la placa con los 96 pocillos, ya la estamos aplicando el láser.

213
00:33:48,710 --> 00:33:53,130
Las moléculas se ionizan y se vaporizan, pasan a fase gas.

214
00:33:53,130 --> 00:34:04,109
Se aplica un voltaje y entonces las moléculas se mueven hasta llegar al detector.

215
00:34:23,130 --> 00:34:45,630
Vale, pues hasta aquí, porque este ya es otro tipo.

216
00:34:48,110 --> 00:34:57,610
Pues esto sería la técnica Malditoz.

217
00:34:58,869 --> 00:35:02,570
Y ahora vamos a ver los ensayos inmunológicos.

218
00:35:02,570 --> 00:35:08,010
Vamos a ver cómo podemos detectar proteínas mediante estos ensayos inmunológicos.

219
00:35:08,889 --> 00:35:13,190
Entonces, antes de nada, vamos a hablar un poquito de, bueno, tenemos estas técnicas.

220
00:35:14,170 --> 00:35:21,730
La técnica ELISA y luego tenemos otros ensayos como el Western Blot, la hema glutinación y la glutinación en látex.

221
00:35:23,969 --> 00:35:26,670
Vamos a ver un poco lo que es el sistema inmunitario.

222
00:35:26,670 --> 00:35:35,170
Entonces, bueno, el sistema inmunitario, proviene del vocablo romano que significa estar libre

223
00:35:35,170 --> 00:35:40,570
Y es la capacidad que tenemos los seres vivos de no sufrir continuamente enfermedades

224
00:35:40,570 --> 00:35:51,409
Es decir, que cuando enfermamos por algún virus, pues nuestro cuerpo genera anticuerpos que se llaman

225
00:35:51,409 --> 00:35:58,289
y esos anticuerpos lo que van a hacer es que si nos volvemos a contagiar otra vez con el mismo virus,

226
00:35:58,750 --> 00:36:07,210
esos anticuerpos son como un sistema de defensa que ya identifican ese virus y lo eliminan.

227
00:36:09,579 --> 00:36:16,019
Entonces, el sistema inmunitario lo que hace es eso, proteger al organismo de una serie de agentes infecciosos

228
00:36:16,019 --> 00:36:23,619
que pueden ser bacterias, hongos, parásitos o virus y que ocasionan diferentes enfermedades.

229
00:36:24,579 --> 00:36:30,619
Entonces, el organismo reconoce a estos componentes y inicia una serie de respuestas.

230
00:36:30,820 --> 00:36:34,179
Esta serie de respuestas son lo que llamamos los anticuerpos.

231
00:36:37,659 --> 00:36:41,920
Entonces, el sistema inmunitario, bueno, esto es un poco repetición, es un sistema de defensa

232
00:36:41,920 --> 00:36:55,280
Y está formado por una serie de mecanismos que protegen al organismo frente a agentes patógenos. A estos agentes patógenos los denominamos antígenos.

233
00:36:55,280 --> 00:37:19,639
Entonces, tenemos el agente patógeno, que es el antígeno, que es el que nos infecta, que puede ser una bacteria, un virus. Y luego tenemos el anticuerpo, que es el sistema de defensa, que son los compuestos que nuestro cuerpo genera para defenderse de estos antígenos.

234
00:37:19,639 --> 00:37:36,260
O sea, antígeno y anticuerpo. Los antígenos se pueden, bueno, vamos a abrirlo aquí. Aquí os he puesto unos vídeos de este investigador, Alfredo Corel, que están muy bien. Por si tenéis tiempo y les echáis un vistazo.

235
00:37:36,260 --> 00:37:50,059
Entonces, antígeno lo representamos como AG y es aquel, cualquier sustancia que va a provocar una respuesta inmunitaria, es decir, que va a estimular la producción de anticuerpos.

236
00:37:50,059 --> 00:38:07,760
Son moléculas complejas y son normalmente proteínas o polisacáridos. Estos son los antígenos. Y luego los anticuerpos se llaman también inmunoglobulinas y son glucoproteínas.

237
00:38:07,760 --> 00:38:12,760
Si os acordáis cuando vimos las proteínas, teníamos homoproteínas y teníamos heteroproteínas.

238
00:38:13,860 --> 00:38:16,039
Pues este es un caso de heteroproteínas.

239
00:38:16,280 --> 00:38:20,980
Son proteínas que están compuestas de proteína y de hidratos de carbono.

240
00:38:22,639 --> 00:38:25,960
Ahora, estos anticuerpos lo que hacen es, lo que ya os he dicho,

241
00:38:26,139 --> 00:38:31,639
identificar y neutralizar elementos extraños, tales como bacterias, virus o parásitos.

242
00:38:32,340 --> 00:38:35,679
Y el anticuerpo lo que va a hacer es unirse al antígeno.

243
00:38:35,679 --> 00:38:45,659
Ahora, esta unión antígeno-anticuerpo es específica, mirad aquí, en esta gráfica se ve muy bien

244
00:38:45,659 --> 00:38:56,059
Este sería un anticuerpo, los anticuerpos hemos dicho que son proteínas y los antígenos hemos dicho que pueden ser proteínas o polisacáridos

245
00:38:56,059 --> 00:39:07,800
Estos son anticuerpos. Los anticuerpos están formados por cuatro cadenas. Dos cadenas largas de aminoácidos y dos cadenas más cortas de aminoácidos.

246
00:39:09,019 --> 00:39:21,179
Cada anticuerpo tiene aquí un fragmento que se llama epítopo y que hace que la reacción antígeno-anticuerpo sea específica.

247
00:39:21,179 --> 00:39:26,179
Es decir, que hay un anticuerpo para cada antígeno.

248
00:39:27,139 --> 00:39:36,920
Si nos infectamos con el virus, la viruela, por ejemplo, pues hay un anticuerpo específico para ese virus.

249
00:39:39,260 --> 00:39:44,199
Si os fijáis aquí tenemos varios antígenos de distintos colores y con distintas formas

250
00:39:44,199 --> 00:39:53,599
y solamente este es el que encaja aquí, el que reacciona con el, o sea, se uniría a este anticuerpo.

251
00:39:54,159 --> 00:39:56,360
Por eso la reacción es específica.

252
00:40:01,260 --> 00:40:07,300
Entonces, las técnicas inmunológicas se basan en esta especificidad de unión antígeno-anticuerpo

253
00:40:07,300 --> 00:40:14,579
porque cuando el antígeno se une al anticuerpo, pues se producen fenómenos que pueden ser una precipitación,

254
00:40:14,579 --> 00:40:26,320
una aglutinación, que son visualizables, que se pueden observar, si el antígeno es específico de ese anticuerpo.

255
00:40:30,070 --> 00:40:33,210
Bien, pues vamos a ver esta técnica, la técnica ELISA.

256
00:40:34,409 --> 00:40:41,550
Esta técnica ELISA, ELISA viene del acrónimo también del inglés, Enzyme-Linked Immunosorbent Assay.

257
00:40:41,550 --> 00:40:48,170
Es el ensayo por inmunoobsorción ligado a enzimas.

258
00:40:49,869 --> 00:40:54,610
Pasáis ensayo e inmunoobsorción ligado a enzimas.

259
00:40:58,260 --> 00:41:02,980
Bueno, vamos a ver qué consiste esta técnica.

260
00:41:03,860 --> 00:41:08,280
El equipo que se utiliza para esta técnica es un espectrofotómetro.

261
00:41:08,280 --> 00:41:19,300
Es un espectrofotómetro y aquí también tenemos una placa parecida a la técnica Malditor que tiene una serie de pocillos.

262
00:41:20,300 --> 00:41:26,420
Entonces un espectrofotómetro lo que va a medir es por ejemplo en este caso vamos a medir cambio de color.

263
00:41:29,500 --> 00:41:36,300
Esta sería la placa y aquí vemos los pocillos con distintos colores, pues eso es lo que nos va a medir el espectrofotómetro.

264
00:41:36,300 --> 00:41:47,159
fotómetro. Vamos a ver cómo se producen estos diferentes colores. Bueno, la técnica consiste

265
00:41:47,159 --> 00:41:55,159
en que vamos a reaccionar el antígeno con el anticuerpo. Imaginaros que aquí en rojo tenemos

266
00:41:55,159 --> 00:42:04,059
un antígeno. El antígeno es el agente patógeno y le añadimos un anticuerpo que tiene esta forma

267
00:42:04,059 --> 00:42:11,440
de aquí, ¿vale? Añadimos un anticuerpo. Si el antígeno reacciona con el anticuerpo,

268
00:42:11,559 --> 00:42:20,360
pues se quedará unido. Ahora, le añadimos otro anticuerpo, que sería este de aquí,

269
00:42:20,980 --> 00:42:27,480
pero este anticuerpo tiene unido una enzima, que es esta de aquí en amarillo, esta enzima.

270
00:42:27,480 --> 00:42:37,559
Entonces ahora ya tenemos el antígeno en rojo, un anticuerpo y otro anticuerpo que está unido a una enzima, esto de aquí en amarillo

271
00:42:37,559 --> 00:42:42,519
Y ahora le añadimos un sustrato que sería esto de aquí en blanco

272
00:42:42,519 --> 00:42:49,320
Y este sustrato al unirse a la enzima, es un sustrato que reacciona con esta enzima que tenemos aquí

273
00:42:49,320 --> 00:42:54,139
Pues al unirse con esta enzima produce un cambio de color

274
00:42:54,139 --> 00:42:58,059
Y esto es lo que vamos a detectar, este cambio de color.

275
00:43:01,219 --> 00:43:06,360
Ahora no nos va a dar tiempo, pero si eso, veis este vídeo que he puesto aquí.

276
00:43:07,480 --> 00:43:19,260
Entonces tenemos el antígeno en rojo, le añadimos un anticuerpo, le añadimos otro anticuerpo con una enzima, que es esta de aquí, de color amarillo, y le añadimos un sustrato.

277
00:43:19,260 --> 00:43:22,840
y este sustrato va a reaccionar con la enzima

278
00:43:22,840 --> 00:43:27,039
y se va a producir un cambio de color en la disolución que tenemos

279
00:43:27,039 --> 00:43:28,619
y eso es lo que vamos a medir.

280
00:43:31,980 --> 00:43:34,159
Entonces tenemos varios tipos de técnica ELISA.

281
00:43:34,159 --> 00:43:37,840
Tenemos el ELISA directo, el ELISA indirecto y el ELISA sandwich.

282
00:43:39,980 --> 00:43:42,300
El ELISA directo, este es el más sencillo.

283
00:43:42,619 --> 00:43:47,300
En este simplemente ponemos en los pocillos el antígeno

284
00:43:47,300 --> 00:43:51,300
y le añadimos anticuerpos que están marcados,

285
00:43:51,300 --> 00:44:10,300
Es decir, que anticuerpos con una enzima. Ahora, si le añadimos después el sustrato y observamos si hay presencia o no de antígenos, si la solución cambia de color, es que el anticuerpo es el específico de ese antígeno.

286
00:44:10,300 --> 00:44:19,059
antígeno. En este caso hay que añadir también controles negativos, es decir, muestras que

287
00:44:19,059 --> 00:44:26,280
sabemos que no tienen el antígeno buscado y también se ponen controles positivos, muestras

288
00:44:26,280 --> 00:44:32,179
que sí sabemos con seguridad que tienen el antígeno buscado. Entonces este es el ELISA

289
00:44:32,179 --> 00:44:39,719
directo, que este es el más sencillo. Después tenemos el ELISA indirecto. El ELISA indirecto

290
00:44:39,719 --> 00:44:47,739
es el que os he explicado antes. Tendríamos aquí el antígeno. Esto de aquí es lavar

291
00:44:47,739 --> 00:44:53,760
para eliminar los antígenos que no se hayan quedado pegados al pocillo. Le añadimos un

292
00:44:53,760 --> 00:44:59,219
anticuerpo específico para ese antígeno. Lavamos también para eliminar los anticuerpos

293
00:44:59,219 --> 00:45:05,539
que no se hayan quedado pegados. Le añadimos otro anticuerpo. Este anticuerpo tiene una

294
00:45:05,539 --> 00:45:12,099
enzima, que es esta de aquí. Y ahora le añadimos un sustrato, que es el que va a reaccionar

295
00:45:12,099 --> 00:45:19,179
con esa enzima. Y si os fijáis hay un cambio de color. La disolución de azul ha pasado

296
00:45:19,179 --> 00:45:26,059
a amarilla. Pues esto es lo que vamos a detectar. La mayor cantidad de antígeno, pues más

297
00:45:26,059 --> 00:45:34,179
color se producirá aquí. Y eso es lo que medimos en el espectrofotómetro. Y el siguiente

298
00:45:34,179 --> 00:45:39,340
que tenemos es el ELISA sandwich. Es parecido, lo que pasa que aquí en vez de poner antígeno

299
00:45:39,340 --> 00:45:47,199
en el pocillo primero ponemos un anticuerpo. Le añadimos el antígeno, o sea el agente

300
00:45:47,199 --> 00:45:56,800
patógeno que va a reaccionar con ese anticuerpo que tenemos. Lavamos y añadimos otro segundo

301
00:45:56,800 --> 00:46:00,960
un anticuerpo que este tiene la enzima, tiene unida una enzima.

302
00:46:01,719 --> 00:46:08,659
Y lo mismo, aquí añadimos un sustrato, pues cuando reaccione ese sustrato con esa enzima

303
00:46:08,659 --> 00:46:10,739
se va a producir un cambio de color.

304
00:46:11,940 --> 00:46:17,639
Si fuera que hemos añadido, o sea que esta reacción no se produce,

305
00:46:17,800 --> 00:46:21,079
que ese anticuerpo no es específico de este antígeno,

306
00:46:21,440 --> 00:46:24,860
pues cuando lleguemos aquí no se va a observar cambio de color,

307
00:46:24,860 --> 00:46:34,239
porque este antígeno no se va a quedar unido al anticuerpo, entonces no observaremos cambio de color.

308
00:46:35,340 --> 00:46:43,960
Este es el ELISA sandwich, tenemos ELISA directo, ELISA indirecto, estos dos, el directo y el indirecto,

309
00:46:44,019 --> 00:46:51,860
son los que primero ponemos el antígeno y el ELISA sandwich son los que primero ponemos el anticuerpo.

310
00:46:51,860 --> 00:47:20,280
Entonces, esta técnica lisa, ¿para qué nos sirve? Pues podemos diagnosticar una infección por un virus, por ejemplo, podemos detectar una hormona, podemos detectar la presencia de drogas, podemos diagnosticar una infección, pero analizando los anticuerpos que se han creado.

311
00:47:20,280 --> 00:47:30,679
Cuando nosotros nos infectamos, generan anticuerpos en nuestro organismo, pues podemos analizar esos anticuerpos.

312
00:47:31,500 --> 00:47:40,579
Nosotros, por ejemplo, podemos haber pasado una enfermedad, pero de forma leve y a lo mejor no nos hemos dado cuenta.

313
00:47:40,579 --> 00:47:49,000
y al cabo de los años nos hacen un análisis, nos miran los anticuerpos y observan que nos dicen

314
00:47:49,000 --> 00:47:56,380
bueno pues si tú has pasado la hepatitis A por ejemplo, porque tienes anticuerpos de haber pasado la hepatitis A

315
00:47:56,380 --> 00:48:04,599
entonces lo que podemos diagnosticar son anticuerpos o diagnosticar directamente los antígenos

316
00:48:04,599 --> 00:48:09,719
pues los antígenos del virus del HIV, el virus de cólera, etc.

317
00:48:13,239 --> 00:48:35,559
Vale, y hay otros ensayos inmunológicos. Este sería el Western Blot. Si os acordáis, en ADN también vimos el Southern Blot y el Northern Blot. Si os acordáis, el Northern era para ARN. Pues este es parecido, lo que pasa que este es para proteínas y se llama Western Blot.

318
00:48:35,559 --> 00:48:58,760
Y lo que se hace es separar las proteínas mediante electroforesis, aquí sería electroforesis en gel de poliacrilamida, este sería el gel de poliacrilamida, ya hecha la electroforesis y lo que hacemos es pasar este ADN a una membrana de nitrocelulosa.

319
00:48:58,760 --> 00:49:20,000
Y ahora con esta membrana de nitrocelulosa lo que hacemos es incubar este ADN que tenemos aquí con un anticuerpo y así podemos detectar si hay una reacción específica entre este antígeno que teníamos y el anticuerpo que hemos añadido.

320
00:49:21,460 --> 00:49:25,800
Esta sería otra forma de hacer el análisis inmunológico.

321
00:49:28,760 --> 00:49:50,909
Vale, pues esto sería este apartado del apartado 4 del tema 2, ¿vale? Vamos a ver ahora, bueno, no sé, ¿tenéis alguna duda de todo esto que os he contado?

322
00:49:50,909 --> 00:50:11,800
No. Vale, pues si queréis vemos lo que me preguntabais del ejercicio de bioinformática.

323
00:50:11,800 --> 00:51:01,070
tenemos que entrar en esta base de datos

324
00:51:01,070 --> 00:51:02,929
en la del NCBI

325
00:51:02,929 --> 00:51:04,989
y ahora tenemos que buscar

326
00:51:04,989 --> 00:51:07,309
este gen, el Clostridium

327
00:51:07,309 --> 00:51:08,230
botulinum

328
00:51:08,230 --> 00:51:10,989
entonces lo que tenemos que hacer

329
00:51:10,989 --> 00:51:12,590
es si entramos en esta página

330
00:51:12,590 --> 00:51:19,710
entramos en esta página

331
00:51:19,710 --> 00:51:20,909
y tenemos que entrar aquí

332
00:51:20,909 --> 00:51:22,449
en genes

333
00:51:22,449 --> 00:51:27,599
y aquí tenemos que escribir

334
00:51:27,599 --> 00:51:28,500
esta

335
00:51:28,500 --> 00:51:35,360
aquí tenemos que escribir

336
00:51:35,360 --> 00:51:38,039
aquí tenemos que buscar esta

337
00:51:38,039 --> 00:51:40,239
neurotoxin B clostridium

338
00:51:40,239 --> 00:51:42,320
y entonces nos aparecen

339
00:51:42,320 --> 00:51:44,400
un montón de secuencias

340
00:51:44,400 --> 00:51:52,159
Nos aparecerán las secuencias que tiene este gen

341
00:51:52,159 --> 00:51:57,539
Y ahora, en esa misma página

342
00:51:57,539 --> 00:52:00,820
Lo que hacemos es buscar el código del gen

343
00:52:00,820 --> 00:52:02,880
El nombre y el tipo

344
00:52:02,880 --> 00:52:08,039
A ver, es que tampoco quiero hacerlo

345
00:52:08,039 --> 00:52:14,420
Vamos a abrir una ventana nueva

346
00:52:14,420 --> 00:52:19,039
vale, aquí entraríamos

347
00:52:19,039 --> 00:52:19,559
aquí

348
00:52:19,559 --> 00:52:21,920
y aquí pondríamos

349
00:52:21,920 --> 00:52:24,860
leer el neurotoxin

350
00:52:24,860 --> 00:52:25,780
de clostrid

351
00:52:25,780 --> 00:52:33,659
y le damos a buscar

352
00:52:33,659 --> 00:52:38,219
vale

353
00:52:38,219 --> 00:52:41,840
y aquí tenéis que buscar

354
00:52:41,840 --> 00:52:44,360
las secuencias y luego aquí os dice

355
00:52:44,360 --> 00:52:45,340
para

356
00:52:45,340 --> 00:52:47,980
ahora, no, aquí

357
00:52:47,980 --> 00:52:49,800
dentro de la página

358
00:52:49,800 --> 00:52:52,119
escoge un gen, por ejemplo

359
00:52:52,119 --> 00:52:53,760
el que aparece en segundo lugar

360
00:52:53,760 --> 00:52:55,739
pues nos vamos aquí

361
00:52:55,739 --> 00:52:57,780
y escogemos este gen

362
00:52:57,780 --> 00:53:00,059
este, el que nos dice

363
00:53:00,059 --> 00:53:02,099
el que aparece en segundo lugar

364
00:53:02,099 --> 00:53:03,719
pues le damos aquí

365
00:53:03,719 --> 00:53:06,059
y

366
00:53:06,059 --> 00:53:08,400
y pinzamos

367
00:53:08,400 --> 00:53:11,239
¿vale? entonces

368
00:53:11,239 --> 00:53:13,760
lo primero, lo de la secuencia, ¿dónde está?

369
00:53:14,980 --> 00:53:16,159
lo de la secuencia

370
00:53:16,159 --> 00:53:19,940
a ver

371
00:53:19,940 --> 00:53:51,829
Las secuencias, a ver, las secuencias yo creo que son estas, 97, sí, las secuencias yo creo que son estas, 97 secuencias.

372
00:53:52,690 --> 00:53:53,949
Sí, las 97, vale.

373
00:53:53,949 --> 00:54:17,619
Sí, sí. Y entonces lo que tenemos que seleccionar es, dentro de la página escoge un gen y entonces cogemos el 2 y le damos aquí.

374
00:54:17,619 --> 00:54:40,539
¿Le hemos dado ya? Vale, y aquí ya nos pone, nos da más datos de este gen, entonces aquí ya, si os acordáis el otro día, bueno, el otro día os lo envié un vídeo grabado.

375
00:54:40,539 --> 00:54:44,320
podemos entrar aquí, si le damos aquí a FASTA

376
00:54:44,320 --> 00:54:46,159
nos aparece toda la secuencia

377
00:54:46,159 --> 00:54:50,139
de aminoácidos

378
00:54:50,139 --> 00:54:53,599
de nucleótidos de este gen

379
00:54:53,599 --> 00:54:56,659
esta sería toda esta secuencia, este es el formato

380
00:54:56,659 --> 00:54:57,840
FASTA

381
00:54:57,840 --> 00:55:01,159
y luego si le damos aquí a GIMBANK

382
00:55:01,159 --> 00:55:08,059
a ver porque nos piden, nos piden cuál es el código del gen

383
00:55:08,059 --> 00:55:10,139
cuál es el nombre del gen y qué tipo de gen es

384
00:55:10,139 --> 00:55:49,420
Pues aquí ya tenemos que buscar el código y el nombre del gen. Aquí tenéis que buscar. Y aquí también nos piden, ahora, obten la secuencia de aminoácidos, de nucleótidos, pinchando en Gimpang.

385
00:55:50,239 --> 00:55:55,139
Dice cuántos nucleótidos tiene esta secuencia, escribe la última línea y su complementaria.

386
00:55:55,900 --> 00:56:04,019
Pues aquí, para buscar el número de secuencias, el número de secuencias sería esta, 1.497 pares de bases.

387
00:56:07,599 --> 00:56:16,219
Y aquí tenéis la última fila, que sería esta.

388
00:56:16,219 --> 00:56:28,840
Sería A, T, G, G, G, A, A, T. Entonces, toda esta fila tenéis que escribir la última línea y su complementaria. Pues tenéis que hacer la complementaria.

389
00:56:28,840 --> 00:56:48,840
Aquí están todas las bases nitrogenadas, los nucleótidos, y el 1 llega hasta el 61, 62, 63, 64, 121, 122, 123, hasta el 1441.

390
00:56:48,840 --> 00:56:58,440
Este sería el 1442, 1443, 1444, pues así llegamos hasta el 1497 pares de bases.

391
00:56:58,840 --> 00:57:02,320
Y de esta última fila tendrías que hacerla complementaria.

392
00:57:07,949 --> 00:57:10,789
Obtén la secuencia de formato FASTA, lo que ya hemos visto.

393
00:57:10,949 --> 00:57:14,269
Realiza un BLAST o alineamiento de secuencias de este gen.

394
00:57:15,349 --> 00:57:19,929
¿Cuántos genes procedentes de microorganismos distintos a Clostridium?

395
00:57:20,369 --> 00:57:23,809
Consecuencia más parecida a la de neurotoxinas encontrado.

396
00:57:23,989 --> 00:57:24,630
Indícalos.

397
00:57:26,030 --> 00:57:30,570
Vale, bueno, intentad volver a hacerlo.

398
00:57:30,570 --> 00:57:37,769
y ya si no sabéis, ya volvemos otra vez a ello el próximo día.

399
00:57:39,349 --> 00:57:40,150
Vale.

400
00:57:40,869 --> 00:57:43,360
Vale, gracias.

401
00:57:47,960 --> 00:57:55,880
Y sobre el examen que me preguntabais el otro día,

402
00:57:57,000 --> 00:58:01,460
ya tuvimos reunión y lo que vamos a hacer va a ser examen

403
00:58:01,460 --> 00:58:12,739
examen un formato más o menos parecido para todos los módulos y serán preguntas de teoría

404
00:58:12,739 --> 00:58:23,380
que serán de tipo, habrá preguntas de tipo test que serán pues, no sé, 30 o 40 preguntas

405
00:58:23,380 --> 00:58:37,599
de tipo test, que se irán a contestar seguramente cuatro, o sea, habrá cuatro respuestas y serán

406
00:58:37,599 --> 00:58:47,079
preguntas de test y luego habrá también preguntas de verdadero o falso. Entonces, de las preguntas

407
00:58:47,079 --> 00:58:56,179
de test, si pongo cuatro opciones, pues cada cuatro que estén mal restará una bien. Si

408
00:58:56,179 --> 00:59:05,280
hubieran tres opciones, cada tres mal restará una bien. Y el porcentaje pues será más

409
00:59:05,280 --> 00:59:09,840
o menos entre, todavía no lo tengo fijo, pero será entre, o sea, habrá eso, preguntas

410
00:59:09,840 --> 00:59:14,760
de test, preguntas de verdadero o falso y luego habrá también pues algún supuesto

411
00:59:14,760 --> 00:59:15,860
práctico

412
00:59:15,860 --> 00:59:18,460
algún supuesto práctico que será

413
00:59:18,460 --> 00:59:19,460
por ejemplo

414
00:59:19,460 --> 00:59:21,940
hacer

415
00:59:21,940 --> 00:59:25,000
será sobre

416
00:59:25,000 --> 00:59:27,159
cromatografía en capa

417
00:59:27,159 --> 00:59:27,920
fina por ejemplo

418
00:59:27,920 --> 00:59:31,019
o electroforesis en

419
00:59:31,019 --> 00:59:33,300
gel de acrilamida

420
00:59:33,300 --> 00:59:35,079
por ejemplo, ver un

421
00:59:35,079 --> 00:59:36,599
resultado y decir

422
00:59:36,599 --> 00:59:38,900
que se ha obtenido

423
00:59:38,900 --> 00:59:40,440
como sea

424
00:59:40,440 --> 00:59:43,059
perdón, el supuesto

425
00:59:43,059 --> 00:59:47,380
práctico es algo que se vio en la práctica, alguna de las prácticas que hicimos en el

426
00:59:47,380 --> 00:59:54,760
laboratorio. Algo parecido, sí, parecido a las prácticas, pero bueno, también están

427
00:59:54,760 --> 01:00:02,039
explicadas en clase, porque lo digo por si alguno no ha venido a las prácticas, también

428
01:00:02,039 --> 01:00:07,280
en clase, pues por ejemplo la cromatografía en capa fina se ha visto también en clase

429
01:00:07,280 --> 01:00:22,800
Y, bueno, pues sería algo así y contaría, pues eso, como un 40-60% cada la parte de teoría y la parte de supuestos prácticos.

430
01:00:22,800 --> 01:00:40,480
Y luego estaría también a los que habéis entregado las prácticas, habéis hecho las autoevaluaciones, etc. Pues ahí hay, creo que es alrededor de un 20%, que eso también cuenta.

431
01:00:40,559 --> 01:00:47,760
Que eso nunca va a servir para bajar notas, si cuenta es para subir nota.

432
01:00:47,760 --> 01:00:56,679
Una pregunta, ¿el factor de corrección que usted acaba de decir es solamente para las preguntas tipo test?

433
01:00:57,519 --> 01:01:14,119
Las de tipo test contarán eso, si están cuatro mal restan una bien y luego las de verdadero o falso, pues las de verdadero o falso todavía no estoy muy segura, pero yo creo que serán si hay dos mal restan una bien.

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De todas formas, eso os lo subo al aula virtual y así lo tenéis más claro.

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Cuando ya tenga un poco más pensado el examen, pues ya os lo pongo en el aula virtual.

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Vale, vale, gracias.

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Voy a detener la grabación.