Videoconferencia 14 mayo - Contenido educativo
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Pues, vamos a ver esta unidad de trabajo, que es la 5, que nos habla de toxicidad y mutagenicidad.
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Bueno, pues vamos a ver qué es esto.
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Vale, pues lo primero, un agente tóxico es aquel compuesto que tiene actividad tóxica y que está producida por un ser vivo
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y que además da lugar a intoxicaciones que pueden ser de carácter muy grave y de origen alimentario.
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Aquí se ha puesto el hongo este, la manita sphaloides, que es el hongo, bueno, se llama hongo de la muerte
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porque es el hongo más mortífero del mundo, que es responsable del 90% de las intoxicaciones relacionadas con setas.
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Tiene origen en Europa, pero ya se ha extendido por todo el mundo.
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Y este hongo lo que tiene es que contiene unas amatoxinas que lo que hacen es impedir que se sinteticen las proteínas.
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Los agentes tóxicos pueden ser de dos tipos según su origen.
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Pueden ser de origen natural y de origen antropogénico.
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Los de origen natural son por ejemplo los vegetales como lo que acabamos de ver.
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De origen animal puede ser por ejemplo la tetrodoxina del pez globo y también pueden ser microorganismos,
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pueden ser bacterias, por ejemplo la toxina botulínica, pueden ser hongos filamentosos también que son los que producen micotoxinas.
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Estos serían los agentes tóxicos naturales. Y después tenemos los agentes tóxicos antropogénicos. Antropogénicos quiere decir que provienen de la acción del hombre.
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Y estos agentes tóxicos antropogénicos son contaminantes ambientales que tienen origen en la industria o también puede ser de origen agrícola.
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Entonces, pues tenemos, por ejemplo, los PCBs, que son los policlorobiferilos. Casi todos los compuestos que contienen cloro son de este tipo, agentes tóxicos.
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Y también tenemos los plaguicidas, los plaguicidas organoclorados. Un ejemplo es este aquí, que es este hexano que tiene seis cloros. Y este es el lindano.
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Bueno, en este hay un caso, hubo un caso en Salén de Gallego, en Huesca, en un pueblecito de Huesca, donde había una industria en la que se sintetizaba este compuesto, el lindano, la industria cerro, pero claro, los suelos siguieron estando contaminados.
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Y este producto se fue pasando hacia las aguas hasta llegar a las aguas potables, lo que produjo efectos adversos a los ciudadanos de allí, que salen de Gallego.
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Esto sería la división de los agentes tóxicos en función de su origen, naturales y antropogénicos.
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Ahora, un agente tóxico, no se puede decir que una sustancia tóxica sea tóxica de manera absoluta, sino que el efecto adverso va a depender de la concentración.
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Puede ser que el agente tóxico esté a bajas concentraciones y entonces el efecto sea positivo
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O que esté a una alta concentración y el efecto va a ser negativo
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Dependiendo del agente tóxico, pues tendrá una concentración u otra en la que va a tener efectos adversos o no
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Entonces, bueno, la variación del efecto sobre, o sea, de la dosis sobre el efecto, pues, es una variación sigmoidea de este tipo
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Entonces, a bajas dosis el efecto es mínimo y el efecto va aumentando hasta que llega a una dosis determinada en que el efecto ya es máximo
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Bueno, pues, esos serían los agentes tóxicos
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Y ahora tenemos los agentes mutagénicos. Los agentes mutagénicos son los que ejercen su toxicidad sobre el ADN y lo que hacen es cambiar la estructura del ADN.
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Lo característico de estos agentes es que no hay un umbral de concentración en el que digamos pues este tiene efectos adversos como al igual que en los agentes tóxicos, sino que aquí la respuesta es positiva o negativa.
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O sea, ¿es mutagénico o no es mutagénico? Y un ejemplo de agente mutagénico, ahí tenéis en el recuadro que pone para saber más, ahí tenéis un vídeo que os explica la alteración de la estructura del ADN debido a la radiación ultravioleta.
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Y, bueno, así un poco resumido, lo que hace la luz ultravioleta es que cuando tenemos, esto sería la cadena de ADN, y tenemos dos timinas, pues la luz ultravioleta lo que hace es generar enlaces covalentes entre dos timinas que estén consecutivas.
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¿Veis? Aquí tenemos dos timinas, pues genera enlaces covalentes entre estas dos timinas.
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Este efecto se puede corregir, hay unas enzimas que corrijan este efecto, pero esto es lo que produce la luz ultravioleta.
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En cuanto a tipos de compuestos mutagénicos, tenemos en función de su tamaño, pueden provocar mutaciones génicas o puntuales o mutaciones cromosómicas.
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Las que vamos a ver son las mutaciones génicas o puntuales. Vamos a centrarnos en estas. Mutaciones cromosómicas son mutaciones que ocurren en los cromosomas. Vamos a ver las génicas o puntuales.
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puntuales. Estas mutaciones, hemos dicho que los agentes mutagénicos afectan a la estructura
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del ADN. Bueno, estas mutaciones son de pequeño tamaño, solo modifican a unos pocos pares
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de bases, son reversibles y pueden ocasionar cambios en los aminoácidos. Si os acordáis
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Cuando estudiamos el dogma central de la biología molecular, veíamos que el ADN se replica, luego el ADN se transcribe a ARN mensajero y de ARN mensajero se traduce a proteínas.
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Y veíamos que cada tres nucleótidos, o sea, cada triplete, da lugar a un aminoácido.
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Bueno, pues vamos a ver cómo si cambiamos uno de los nucleótidos puede dar lugar a un cambio en aminoácidos y eso puede dar lugar a un cambio de proteína.
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Entonces, ¿qué posibilidades tenemos de cambio?
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Pues puede ser. Aquí tenemos una cadena normal de ADN, citosina, adenina, timina, citosina, adenina, timina, citosina, adenina, timina.
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Esta sería la cadena de ADN.
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¿Qué puede ocurrir? Puede ocurrir que una de las bases cambie.
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Es decir, aquí tenemos adenina, pues se ha convertido en citosina.
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Aquí ya se ha producido un cambio.
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Otra de las cosas que puede ocurrir es que haya una adición, que se adicione un nucleótido
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Aquí tenemos citosina, adenina, timina, citosina, adenina, igual que aquí
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Pero aquí ahora se han añadido dos guaninas
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Por lo que esto va a producir un cambio en los aminoácidos
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Y luego ya continúa, timina, citosina, adenina, timina, ya igual
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Aquí se han añadido dos guaninas. Y otra cosa que puede ocurrir es la supresión, que se suprima uno o más bases nitrogenadas. Por ejemplo, aquí se ha suprimido la adenina y la timina.
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Si os fijáis aquí hay una citosina, que es esta de aquí, se han suprimido estas dos, la adenina y la timina, y vuelve a haber otra vez una citosina, adenina y timina.
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Vamos a ver cómo pueden afectar estos cambios a la síntesis de proteínas.
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Bueno, aquí os he puesto el código genético.
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Si os acordáis el código genético estaba degenerado y eso significaba que varios tripletes pueden dar lugar al mismo aminoácido.
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Por ejemplo aquí si tenemos citosina, uracilo, uracilo, citosina, uracilo, citosina da lugar a la leucina o si tenemos citosina, uracilo, adenina también da lugar a la leucina.
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Pues entonces, imaginaros que tenemos esta cadena de ADN, esta cadena de ADN en la que tenemos adenina, guanina, timina.
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Este triplete da lugar a la serina, lo buscamos aquí, adenina, guanina, es adenina, guanina, timina.
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Bueno, aquí nos faltaría, adenina o anina
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Ah, bueno, claro, porque sería adenina o anina, sería uracil
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Vale, sí, porque esta es la cadena de ADN
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La que va de 3' a 5', pero la de 5' a 3' sería uracilo, citosina, adenina
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Vamos a ver, uracilo, uracilo, esto es, uracilo, citosina, adenina y da lugar a la serina.
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Vale, tenemos que buscar la cadena, la complementaria.
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Este es el ADN, la cadena de ADN original que va de 3' a 5',
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nosotros la que tenemos que buscar es la del ARN mensajero que va de 5' a 3' y que se da la complementaria a esta.
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La siguiente tenemos citosina, guanina, guanina, o sea que la complementaria será guanina, citosina, citosina, guanina, guanina, citosina, citosina, que da lugar al aminoácido alanina, y así sucesivamente.
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Este sería adenina, timina, guanina, o sea que sería la complementaria, sería uracilo, adenina, citosina, o sea, UAC, tenemos aquí tirosina, esta es la tirosina y la siguiente sería la valina.
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Ahora, si cambiamos uno de los aminoácidos, cambiamos esta citosina y ponemos aquí, o sea, se ha producido una mutación y esta citosina se ha convertido en timina y esta adenina se ha convertido en guanina.
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¿Qué va a ocurrir? Pues bueno, los primeros tres nucleótidos, el primer triplete va a seguir igual, va a dar serina.
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Pero ahora, el siguiente triplete, ¿qué pasa? Que tenemos timina, guanina, guanina, que el complementario sería adenina, citosina, citosina, o sea, ACC. Vamos a buscar el ACC. ACC da lugar a treonina. Por lo tanto, ya nos está cambiando este aminoácido, que antes era alanina.
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El siguiente triplete va a ser igual, es A, T, G, pues va a dar lugar a la tirosina, pero ahora en el siguiente triplete ha habido otro cambio de un nucleótido, tenemos citosina, guanina, timina, pues el complementario será G, C, A.
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Pues GCA da lugar a la alanina. Por lo tanto, esta proteína va a cambiar porque ahora vamos a tener serina, trionina, tirosina y alanina.
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Ahora, si estos cambios, como el código genético está degenerado, estos cambios podrían ser que dieran lugar al mismo aminoácido, que dieran lugar a la anina.
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Imaginaros que se nos formara GCC, guanina, citosina, guanina.
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O sea, que el original, imaginaos que fuera guanina, citosina, uracilo
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Y el que se nos genera, o sea, hay un cambio, una mutación
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Y se nos genera GCC, guanina, citosina, citosina
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Pues los dos darían lugar a la anina
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Por lo tanto, pues no habría cambio en la proteína
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Aquí tendríamos también a la anina
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Vale, esa es una posibilidad
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Y luego, aquí en el archivo también tenéis este otro ejemplo. Dice, si tenemos el siguiente fragmento de ADN que tiene una eliminación de la base indicada.
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Aquí no está pintado
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La que se divina es
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Tenemos
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EGA
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CGG
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Y luego es esta C
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Esta C es la que se ha
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Se ha eliminado
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Ha habido una mutación y se ha eliminado esta citosina
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Vale, pues entonces
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Vamos a buscar lo mismo
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Vamos a buscar el complementario
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La cadena complementaria, esta sería ARN, por lo tanto acordaros que tenemos que tener uracilo y pues sería, aquí tenemos TGA, pues el complementario sería ACU.
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El siguiente GCC, ¿vale? Entonces así vamos buscando en el código genético, vamos buscando cada triplete, vamos buscando qué aminoácido se obtiene.
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Entonces aquí tenemos glicina, tirosina, lisina y valina. Ahora, si se produce una supresión de esta citosina, pues ya los aminoácidos siguientes van a cambiar.
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Además, aquí sí que tenemos el ACU, el primer triplete, el siguiente GCC, igual que en el anterior, pero ahora ya el siguiente va a ser, como tenemos, este se ha eliminado la citosina, pues el siguiente va a ser GUU, o sea que ya nos ha cambiado y se nos ha formado otro aminoácido, que es la valina.
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El siguiente, ya vamos a tener este triplete T-G-T, que el complementario es A-C-A, por lo tanto es treonina.
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Y el siguiente que teníamos, C-A-A, C-A-A es este, luego T-G-T es este, T-G-T-A-C-A.
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Y luego ya tendríamos TTC, o sea que sería adenina, adenina, guanina, que nos va a dar lugar a la lisina. Por lo tanto, esta mutación sí que va a dar lugar a una proteína diferente, porque se cambian los aminoácidos.
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Y una forma de analizar la capacidad mutagénica que tienen diferentes sustancias es mediante el test de AMES.
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Y este test lo desarrolló Bruce Ames y le dieron el premio Nobel por ello.
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Vamos a ver en qué consiste este test.
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Bueno, lo que se utiliza en este test son cepas de salmonella, salmonella tifimurium, son cepas de salmonella que están mutadas,
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están mutados su ADN, de tal forma que esta salmonella no puede sintetizar el aminoácido histidina.
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es una salmonella que tiene modificado su ADN y por lo tanto no puede sintetizar el aminoácido histirina
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por lo que si queremos que produzcan histirina tenemos que poner a estas cepas con histirina en el medio
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para que se puedan replicar y crecer
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Pero, si a estas cepas de salmonella les añadimos un compuesto que sea mutagénico, pues este compuesto mutagénico lo que puede hacer es que revierte al ADN que sí que puede, que tiene capacidad de sintetizar histidina.
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Entonces tenemos salmonella que tiene su ADN mutado, o sea que no puede producir histidina
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Y ahora si le añadimos un compuesto que es mutagénico
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Este compuesto mutagénico puede hacer que esta salmonella que revierta su mutación
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Y que sí que pueda sintetizar histidina, el aminoácido histidina
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Y así es como se ensaya si un compuesto tiene capacidad mutagénica. Entonces tenemos la salmonella que está modificada y este sería un ensayo de control.
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Y aquí tenemos también la salmonella modificada, o sea, el ADN que está mutado, que no puede sintetizar histidina.
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Ahora, a la de arriba le añadimos un mutágeno del que queremos probar si tiene capacidad mutagénica o no.
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y ponemos la salmonella, en este caso con el mutágeno, en una placa Petri
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y este sería el ensayo de control, el que no tiene mutágeno.
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Y lo ponemos en un medio que tiene histidina.
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Entonces, ¿qué pasa?
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que la salmonella va a crecer, pero una vez que se termine la histidina va a dejar de crecer,
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va a dejar de crecer a no ser que en este de aquí arriba que tiene el compuesto mutágeno
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y ese mutágeno ha revertido la mutación de la salmonella
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y entonces sí que puede, o sea, consigue que la salmonella crezca.
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Y en cambio aquí, aquí solamente tenemos la salmonella modificada.
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Como esa salmonella mutada, esa salmonella no puede sintetizar histidina, pues no puede crecer.
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Vale, os lo repito que es un poco complicado.
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En este de aquí arriba tenemos salmonella y tenemos mutágeno, el compuesto mutágeno.
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La salmonella que tenemos está mutada, tiene algún gen que hace que no pueda sintetizar histidina.
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Entonces, al añadir el mutágeno, el compuesto mutágeno
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Lo que ocurre es que el mutágeno hace que ese ADN, ese gen que hacía que no se pudiera producir histidina
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Cambia ese gen, revierte y consigue hacer crecer la salmonella
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Por lo tanto, este compuesto que hemos añadido aquí tiene capacidad mutagénica
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Tiene capacidad de cambiar el ADN
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Vale, pues este sería este tema, el tema 5
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No sé si tenéis alguna duda de este tema
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Este yo creo que es lo más complicado, lo del test de AMES
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Vale, pues bueno, ya habéis visto que este tema es cortito
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Bueno, vamos a ver ahora lo que os decía, el punto 4 del tema 2 que se nos quedó por ver, la identificación de proteínas.
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Bueno, pues vamos a ver este punto y así también hacemos un pequeño repaso de las proteínas.
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Si os acordáis las proteínas estaban formadas por aminoácidos y sus aminoácidos estaban unidos por enlaces peptídicos y teníamos varias estructuras primaria, secundaria, terciaria y algunas podían tener esta estructura cuaternaria.
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Vimos también cómo se podían extraer estas proteínas, las formas de extracción
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Y vimos también cómo se podían cuantificar por el método de Lowry, Bradford, espectrofotométrico
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Y luego vimos que estas proteínas también se podían fraccionar
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Si os acordáis, diálisis, cromatografía, electroforesis
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Pues hoy vamos a ver cómo se pueden identificar estas proteínas
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Vale, entonces vamos a ver estos dos métodos, la técnica Malditov y los ensayos inmunológicos.
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Vamos a empezar por la técnica Malditov. Bueno, pues esta técnica se basa en la técnica de espectrometría de masas, que seguramente los que hayáis estudiado el módulo de análisis instrumental, a lo mejor lo habéis estudiado ya.
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¿Esta técnica de espectrometría de masas en qué consiste?
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Así muy brevemente, lo que vamos a hacer es impactar a nuestra molécula orgánica, que aquí la hemos representado como ABC
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La impactamos con un chorro de electrones y lo que conseguimos es ionizar nuestra muestra, cargarla positivamente
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Y además esto se hace en fase gaseosa
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Entonces vamos a obtener iones a partir de moléculas orgánicas. Y además lo que se hace también es fragmentar esta molécula, la vamos a romper en partes, en trocitos y la vamos a fragmentar.
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Y ahora, los fragmentos que obtenemos, que serán iones, van a tener diferente masa y carga y se van a detectar estos iones.
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Entonces, aquí tenemos un espectro de masas.
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Aquí, por ejemplo, tendríamos esta molécula, que es el butano CH3, CH2, CH2, CH3.
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Lo que hacemos es impactar esta molécula con un chorro de electrones y además se fragmenta. Si os fijáis aquí tenemos un CH3 con carga positiva, aquí tenemos un CH3CH2 con carga positiva, aquí está toda la molécula con carga positiva.
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Entonces, obtenemos distintas fracciones, o sea, distintos iones con distinto tamaño, que luego se separan y lo que nos da es un espectro de masas de este tipo, con estas señales.
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Claro, esto lo podemos hacer para moléculas de este tipo, moléculas pequeñas
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Pero ahora, si queremos hacer esto mismo, pero analizar proteínas
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Proteínas ya sabemos que son macromoléculas
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Por lo tanto, imaginaros que aquí, si fragmentamos las proteínas
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Pues obtendríamos aquí un montón de señales que sería muy difícil identificar
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Pues para eso se elimina ese problema con esta técnica, la técnica MALDI-TOF.
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Estas siglas provienen del inglés y MALDI es de Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Mass Spectrometry.
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O sea, en español, espectrometría de masas de ionización, distorsión, láser asistida por matriz.
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Con esto es con lo que vamos a generar los iones.
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Y luego, ¿cómo analizamos los iones? Pues con el Time of Flight, T-O-F, con este sistema, con el TOF.
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Aquí os he puesto unos vídeos por si queréis echarles un vistazo.
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Vamos a ver entonces qué significa esto de ionización, desorción, láser, asistida por matriz.
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Bueno, lo que podemos conseguir con esta técnica es, lo que os decía, ionizar biomoléculas como péptidos y proteínas sin que se produzca la ruptura de los mismos.
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Y además también se pueden ionizar moléculas no volátiles.
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Si os acordáis, hemos visto que en espectrometría de masas la técnica se hace en fase gas, pues con esta, con la malditoz, se pueden ionizar moléculas no volátiles.
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Vamos a ver cómo se logra esto.
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Lo que hacemos es poner, tenemos una placa, esta placa suele ser de poliestireno, y en esta placa tenemos muchos pocillos.
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Tenemos hasta 96 pocillos, suele ser 96.
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Aquí os he puesto como sería uno de estos pocillos.
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Bien, pues lo que vamos a hacer es, vamos a poner en uno de estos pocillos, vamos a poner una matriz, que aquí está representada en color violeta.
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Y vamos a mezclar esa matriz con nuestra proteína, con la muestra que nosotros queremos analizar, que sería esto de aquí en verde.
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la matriz es simplemente
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pensaba que lo tenía
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la matriz es simplemente un compuesto orgánico
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hay varios tipos de matrices
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pero es un compuesto orgánico
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y lo que se hace es añadir la matriz
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junto con nuestra muestra en estos pocillos
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y ahora lo que hacemos es hacer incidir en estos pocillos un rayo láser
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y con esto que vamos a conseguir que el sólido que tenemos en cada pocillo pase a fase gas,
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que esto sería la desorción.
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El sólido va a pasar a fase gas y obtendríamos esto de aquí.
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al mismo tiempo la matriz se va a cargar positivamente, si veis aquí tenemos cargas positivas
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y ahora esta energía que adquiere la matriz la va a pasar a las moléculas de nuestra muestra,
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a estas verdes y estas moléculas se van a ionizar, van a adquirir carga positiva,
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Lo veis aquí, cargas positivas. Y luego ya estos iones son los que vamos a analizar. Entonces, consiste en irradiar una muestra que está mezclada con una matriz. Al irradiar con un rayo láser, lo que ocurre es que la matriz y la muestra se desorben, o sea, se produce su desorción, pasan a fase gas.
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y la matriz se ioniza y a su vez esa energía que adquiere la transmite a nuestras moléculas en verde
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que también se van a ionizar.
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Y ahora lo que vamos a hacer es separar estos iones, estas cargas positivas
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y eso lo separamos con el analizador de tiempo de vuelo, el TOF.
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Y así brevemente lo que ocurre es que le vamos a aplicar a estas muestras,
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las que tenemos aquí de distinto tamaño, ionizadas, lo que hacemos es aplicarles un campo eléctrico
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y lo que hacen es, se van a ir moviendo hasta llegar al detector.
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Las de menor masa molecular se van a mover más rápidamente y van a llegar antes al detector
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y las de mayor masa molecular van a tardar más en llegar al detector y así es como se detectan.
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Por eso se llama tiempo de vuelo, porque van moviéndose por aquí hasta llegar al detector.
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Simplemente que os suene, analizador de tiempo de vuelo, time of flight.
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Aquí tenemos este vídeo, vamos a verlo un poquito.
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Solamente un poquito para que veáis cómo es la técnica.
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Aquí tenemos la placa con los 96 pocillos, ya la estamos aplicando el láser.
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Las moléculas se ionizan y se vaporizan, pasan a fase gas.
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Se aplica un voltaje y entonces las moléculas se mueven hasta llegar al detector.
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Vale, pues hasta aquí, porque este ya es otro tipo.
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Pues esto sería la técnica Malditoz.
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Y ahora vamos a ver los ensayos inmunológicos.
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Vamos a ver cómo podemos detectar proteínas mediante estos ensayos inmunológicos.
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Entonces, antes de nada, vamos a hablar un poquito de, bueno, tenemos estas técnicas.
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La técnica ELISA y luego tenemos otros ensayos como el Western Blot, la hema glutinación y la glutinación en látex.
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Vamos a ver un poco lo que es el sistema inmunitario.
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Entonces, bueno, el sistema inmunitario, proviene del vocablo romano que significa estar libre
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Y es la capacidad que tenemos los seres vivos de no sufrir continuamente enfermedades
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Es decir, que cuando enfermamos por algún virus, pues nuestro cuerpo genera anticuerpos que se llaman
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y esos anticuerpos lo que van a hacer es que si nos volvemos a contagiar otra vez con el mismo virus,
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esos anticuerpos son como un sistema de defensa que ya identifican ese virus y lo eliminan.
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Entonces, el sistema inmunitario lo que hace es eso, proteger al organismo de una serie de agentes infecciosos
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que pueden ser bacterias, hongos, parásitos o virus y que ocasionan diferentes enfermedades.
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Entonces, el organismo reconoce a estos componentes y inicia una serie de respuestas.
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Esta serie de respuestas son lo que llamamos los anticuerpos.
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Entonces, el sistema inmunitario, bueno, esto es un poco repetición, es un sistema de defensa
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Y está formado por una serie de mecanismos que protegen al organismo frente a agentes patógenos. A estos agentes patógenos los denominamos antígenos.
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Entonces, tenemos el agente patógeno, que es el antígeno, que es el que nos infecta, que puede ser una bacteria, un virus. Y luego tenemos el anticuerpo, que es el sistema de defensa, que son los compuestos que nuestro cuerpo genera para defenderse de estos antígenos.
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O sea, antígeno y anticuerpo. Los antígenos se pueden, bueno, vamos a abrirlo aquí. Aquí os he puesto unos vídeos de este investigador, Alfredo Corel, que están muy bien. Por si tenéis tiempo y les echáis un vistazo.
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Entonces, antígeno lo representamos como AG y es aquel, cualquier sustancia que va a provocar una respuesta inmunitaria, es decir, que va a estimular la producción de anticuerpos.
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Son moléculas complejas y son normalmente proteínas o polisacáridos. Estos son los antígenos. Y luego los anticuerpos se llaman también inmunoglobulinas y son glucoproteínas.
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Si os acordáis cuando vimos las proteínas, teníamos homoproteínas y teníamos heteroproteínas.
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Pues este es un caso de heteroproteínas.
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Son proteínas que están compuestas de proteína y de hidratos de carbono.
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Ahora, estos anticuerpos lo que hacen es, lo que ya os he dicho,
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identificar y neutralizar elementos extraños, tales como bacterias, virus o parásitos.
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Y el anticuerpo lo que va a hacer es unirse al antígeno.
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Ahora, esta unión antígeno-anticuerpo es específica, mirad aquí, en esta gráfica se ve muy bien
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Este sería un anticuerpo, los anticuerpos hemos dicho que son proteínas y los antígenos hemos dicho que pueden ser proteínas o polisacáridos
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Estos son anticuerpos. Los anticuerpos están formados por cuatro cadenas. Dos cadenas largas de aminoácidos y dos cadenas más cortas de aminoácidos.
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Cada anticuerpo tiene aquí un fragmento que se llama epítopo y que hace que la reacción antígeno-anticuerpo sea específica.
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Es decir, que hay un anticuerpo para cada antígeno.
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Si nos infectamos con el virus, la viruela, por ejemplo, pues hay un anticuerpo específico para ese virus.
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Si os fijáis aquí tenemos varios antígenos de distintos colores y con distintas formas
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y solamente este es el que encaja aquí, el que reacciona con el, o sea, se uniría a este anticuerpo.
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Por eso la reacción es específica.
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Entonces, las técnicas inmunológicas se basan en esta especificidad de unión antígeno-anticuerpo
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porque cuando el antígeno se une al anticuerpo, pues se producen fenómenos que pueden ser una precipitación,
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una aglutinación, que son visualizables, que se pueden observar, si el antígeno es específico de ese anticuerpo.
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Bien, pues vamos a ver esta técnica, la técnica ELISA.
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Esta técnica ELISA, ELISA viene del acrónimo también del inglés, Enzyme-Linked Immunosorbent Assay.
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Es el ensayo por inmunoobsorción ligado a enzimas.
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Pasáis ensayo e inmunoobsorción ligado a enzimas.
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Bueno, vamos a ver qué consiste esta técnica.
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El equipo que se utiliza para esta técnica es un espectrofotómetro.
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Es un espectrofotómetro y aquí también tenemos una placa parecida a la técnica Malditor que tiene una serie de pocillos.
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Entonces un espectrofotómetro lo que va a medir es por ejemplo en este caso vamos a medir cambio de color.
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Esta sería la placa y aquí vemos los pocillos con distintos colores, pues eso es lo que nos va a medir el espectrofotómetro.
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fotómetro. Vamos a ver cómo se producen estos diferentes colores. Bueno, la técnica consiste
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en que vamos a reaccionar el antígeno con el anticuerpo. Imaginaros que aquí en rojo tenemos
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un antígeno. El antígeno es el agente patógeno y le añadimos un anticuerpo que tiene esta forma
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de aquí, ¿vale? Añadimos un anticuerpo. Si el antígeno reacciona con el anticuerpo,
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pues se quedará unido. Ahora, le añadimos otro anticuerpo, que sería este de aquí,
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pero este anticuerpo tiene unido una enzima, que es esta de aquí en amarillo, esta enzima.
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Entonces ahora ya tenemos el antígeno en rojo, un anticuerpo y otro anticuerpo que está unido a una enzima, esto de aquí en amarillo
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Y ahora le añadimos un sustrato que sería esto de aquí en blanco
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Y este sustrato al unirse a la enzima, es un sustrato que reacciona con esta enzima que tenemos aquí
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Pues al unirse con esta enzima produce un cambio de color
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Y esto es lo que vamos a detectar, este cambio de color.
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Ahora no nos va a dar tiempo, pero si eso, veis este vídeo que he puesto aquí.
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Entonces tenemos el antígeno en rojo, le añadimos un anticuerpo, le añadimos otro anticuerpo con una enzima, que es esta de aquí, de color amarillo, y le añadimos un sustrato.
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y este sustrato va a reaccionar con la enzima
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y se va a producir un cambio de color en la disolución que tenemos
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y eso es lo que vamos a medir.
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Entonces tenemos varios tipos de técnica ELISA.
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Tenemos el ELISA directo, el ELISA indirecto y el ELISA sandwich.
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El ELISA directo, este es el más sencillo.
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En este simplemente ponemos en los pocillos el antígeno
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y le añadimos anticuerpos que están marcados,
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Es decir, que anticuerpos con una enzima. Ahora, si le añadimos después el sustrato y observamos si hay presencia o no de antígenos, si la solución cambia de color, es que el anticuerpo es el específico de ese antígeno.
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antígeno. En este caso hay que añadir también controles negativos, es decir, muestras que
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sabemos que no tienen el antígeno buscado y también se ponen controles positivos, muestras
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que sí sabemos con seguridad que tienen el antígeno buscado. Entonces este es el ELISA
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directo, que este es el más sencillo. Después tenemos el ELISA indirecto. El ELISA indirecto
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es el que os he explicado antes. Tendríamos aquí el antígeno. Esto de aquí es lavar
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para eliminar los antígenos que no se hayan quedado pegados al pocillo. Le añadimos un
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anticuerpo específico para ese antígeno. Lavamos también para eliminar los anticuerpos
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que no se hayan quedado pegados. Le añadimos otro anticuerpo. Este anticuerpo tiene una
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enzima, que es esta de aquí. Y ahora le añadimos un sustrato, que es el que va a reaccionar
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con esa enzima. Y si os fijáis hay un cambio de color. La disolución de azul ha pasado
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a amarilla. Pues esto es lo que vamos a detectar. La mayor cantidad de antígeno, pues más
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color se producirá aquí. Y eso es lo que medimos en el espectrofotómetro. Y el siguiente
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que tenemos es el ELISA sandwich. Es parecido, lo que pasa que aquí en vez de poner antígeno
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en el pocillo primero ponemos un anticuerpo. Le añadimos el antígeno, o sea el agente
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patógeno que va a reaccionar con ese anticuerpo que tenemos. Lavamos y añadimos otro segundo
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un anticuerpo que este tiene la enzima, tiene unida una enzima.
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Y lo mismo, aquí añadimos un sustrato, pues cuando reaccione ese sustrato con esa enzima
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se va a producir un cambio de color.
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Si fuera que hemos añadido, o sea que esta reacción no se produce,
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que ese anticuerpo no es específico de este antígeno,
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pues cuando lleguemos aquí no se va a observar cambio de color,
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porque este antígeno no se va a quedar unido al anticuerpo, entonces no observaremos cambio de color.
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Este es el ELISA sandwich, tenemos ELISA directo, ELISA indirecto, estos dos, el directo y el indirecto,
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son los que primero ponemos el antígeno y el ELISA sandwich son los que primero ponemos el anticuerpo.
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Entonces, esta técnica lisa, ¿para qué nos sirve? Pues podemos diagnosticar una infección por un virus, por ejemplo, podemos detectar una hormona, podemos detectar la presencia de drogas, podemos diagnosticar una infección, pero analizando los anticuerpos que se han creado.
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Cuando nosotros nos infectamos, generan anticuerpos en nuestro organismo, pues podemos analizar esos anticuerpos.
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Nosotros, por ejemplo, podemos haber pasado una enfermedad, pero de forma leve y a lo mejor no nos hemos dado cuenta.
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y al cabo de los años nos hacen un análisis, nos miran los anticuerpos y observan que nos dicen
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bueno pues si tú has pasado la hepatitis A por ejemplo, porque tienes anticuerpos de haber pasado la hepatitis A
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entonces lo que podemos diagnosticar son anticuerpos o diagnosticar directamente los antígenos
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pues los antígenos del virus del HIV, el virus de cólera, etc.
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Vale, y hay otros ensayos inmunológicos. Este sería el Western Blot. Si os acordáis, en ADN también vimos el Southern Blot y el Northern Blot. Si os acordáis, el Northern era para ARN. Pues este es parecido, lo que pasa que este es para proteínas y se llama Western Blot.
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Y lo que se hace es separar las proteínas mediante electroforesis, aquí sería electroforesis en gel de poliacrilamida, este sería el gel de poliacrilamida, ya hecha la electroforesis y lo que hacemos es pasar este ADN a una membrana de nitrocelulosa.
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Y ahora con esta membrana de nitrocelulosa lo que hacemos es incubar este ADN que tenemos aquí con un anticuerpo y así podemos detectar si hay una reacción específica entre este antígeno que teníamos y el anticuerpo que hemos añadido.
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Esta sería otra forma de hacer el análisis inmunológico.
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Vale, pues esto sería este apartado del apartado 4 del tema 2, ¿vale? Vamos a ver ahora, bueno, no sé, ¿tenéis alguna duda de todo esto que os he contado?
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No. Vale, pues si queréis vemos lo que me preguntabais del ejercicio de bioinformática.
00:49:50
tenemos que entrar en esta base de datos
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en la del NCBI
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y ahora tenemos que buscar
00:51:02
este gen, el Clostridium
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botulinum
00:51:07
entonces lo que tenemos que hacer
00:51:08
es si entramos en esta página
00:51:10
entramos en esta página
00:51:12
y tenemos que entrar aquí
00:51:19
en genes
00:51:20
y aquí tenemos que escribir
00:51:22
esta
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aquí tenemos que escribir
00:51:28
aquí tenemos que buscar esta
00:51:35
neurotoxin B clostridium
00:51:38
y entonces nos aparecen
00:51:40
un montón de secuencias
00:51:42
Nos aparecerán las secuencias que tiene este gen
00:51:44
Y ahora, en esa misma página
00:51:52
Lo que hacemos es buscar el código del gen
00:51:57
El nombre y el tipo
00:52:00
A ver, es que tampoco quiero hacerlo
00:52:02
Vamos a abrir una ventana nueva
00:52:08
vale, aquí entraríamos
00:52:14
aquí
00:52:19
y aquí pondríamos
00:52:19
leer el neurotoxin
00:52:21
de clostrid
00:52:24
y le damos a buscar
00:52:25
vale
00:52:33
y aquí tenéis que buscar
00:52:38
las secuencias y luego aquí os dice
00:52:41
para
00:52:44
ahora, no, aquí
00:52:45
dentro de la página
00:52:47
escoge un gen, por ejemplo
00:52:49
el que aparece en segundo lugar
00:52:52
pues nos vamos aquí
00:52:53
y escogemos este gen
00:52:55
este, el que nos dice
00:52:57
el que aparece en segundo lugar
00:53:00
pues le damos aquí
00:53:02
y
00:53:03
y pinzamos
00:53:06
¿vale? entonces
00:53:08
lo primero, lo de la secuencia, ¿dónde está?
00:53:11
lo de la secuencia
00:53:14
a ver
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Las secuencias, a ver, las secuencias yo creo que son estas, 97, sí, las secuencias yo creo que son estas, 97 secuencias.
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Sí, las 97, vale.
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Sí, sí. Y entonces lo que tenemos que seleccionar es, dentro de la página escoge un gen y entonces cogemos el 2 y le damos aquí.
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¿Le hemos dado ya? Vale, y aquí ya nos pone, nos da más datos de este gen, entonces aquí ya, si os acordáis el otro día, bueno, el otro día os lo envié un vídeo grabado.
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podemos entrar aquí, si le damos aquí a FASTA
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nos aparece toda la secuencia
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de aminoácidos
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de nucleótidos de este gen
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esta sería toda esta secuencia, este es el formato
00:54:53
FASTA
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y luego si le damos aquí a GIMBANK
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a ver porque nos piden, nos piden cuál es el código del gen
00:55:01
cuál es el nombre del gen y qué tipo de gen es
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Pues aquí ya tenemos que buscar el código y el nombre del gen. Aquí tenéis que buscar. Y aquí también nos piden, ahora, obten la secuencia de aminoácidos, de nucleótidos, pinchando en Gimpang.
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Dice cuántos nucleótidos tiene esta secuencia, escribe la última línea y su complementaria.
00:55:50
Pues aquí, para buscar el número de secuencias, el número de secuencias sería esta, 1.497 pares de bases.
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Y aquí tenéis la última fila, que sería esta.
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Sería A, T, G, G, G, A, A, T. Entonces, toda esta fila tenéis que escribir la última línea y su complementaria. Pues tenéis que hacer la complementaria.
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Aquí están todas las bases nitrogenadas, los nucleótidos, y el 1 llega hasta el 61, 62, 63, 64, 121, 122, 123, hasta el 1441.
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Este sería el 1442, 1443, 1444, pues así llegamos hasta el 1497 pares de bases.
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Y de esta última fila tendrías que hacerla complementaria.
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Obtén la secuencia de formato FASTA, lo que ya hemos visto.
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Realiza un BLAST o alineamiento de secuencias de este gen.
00:57:10
¿Cuántos genes procedentes de microorganismos distintos a Clostridium?
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Consecuencia más parecida a la de neurotoxinas encontrado.
00:57:20
Indícalos.
00:57:23
Vale, bueno, intentad volver a hacerlo.
00:57:26
y ya si no sabéis, ya volvemos otra vez a ello el próximo día.
00:57:30
Vale.
00:57:39
Vale, gracias.
00:57:40
Y sobre el examen que me preguntabais el otro día,
00:57:47
ya tuvimos reunión y lo que vamos a hacer va a ser examen
00:57:57
examen un formato más o menos parecido para todos los módulos y serán preguntas de teoría
00:58:01
que serán de tipo, habrá preguntas de tipo test que serán pues, no sé, 30 o 40 preguntas
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de tipo test, que se irán a contestar seguramente cuatro, o sea, habrá cuatro respuestas y serán
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preguntas de test y luego habrá también preguntas de verdadero o falso. Entonces, de las preguntas
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de test, si pongo cuatro opciones, pues cada cuatro que estén mal restará una bien. Si
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hubieran tres opciones, cada tres mal restará una bien. Y el porcentaje pues será más
00:58:56
o menos entre, todavía no lo tengo fijo, pero será entre, o sea, habrá eso, preguntas
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de test, preguntas de verdadero o falso y luego habrá también pues algún supuesto
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práctico
00:59:14
algún supuesto práctico que será
00:59:15
por ejemplo
00:59:18
hacer
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será sobre
00:59:21
cromatografía en capa
00:59:25
fina por ejemplo
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o electroforesis en
00:59:27
gel de acrilamida
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por ejemplo, ver un
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resultado y decir
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que se ha obtenido
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como sea
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perdón, el supuesto
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práctico es algo que se vio en la práctica, alguna de las prácticas que hicimos en el
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laboratorio. Algo parecido, sí, parecido a las prácticas, pero bueno, también están
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explicadas en clase, porque lo digo por si alguno no ha venido a las prácticas, también
00:59:54
en clase, pues por ejemplo la cromatografía en capa fina se ha visto también en clase
01:00:02
Y, bueno, pues sería algo así y contaría, pues eso, como un 40-60% cada la parte de teoría y la parte de supuestos prácticos.
01:00:07
Y luego estaría también a los que habéis entregado las prácticas, habéis hecho las autoevaluaciones, etc. Pues ahí hay, creo que es alrededor de un 20%, que eso también cuenta.
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Que eso nunca va a servir para bajar notas, si cuenta es para subir nota.
01:00:40
Una pregunta, ¿el factor de corrección que usted acaba de decir es solamente para las preguntas tipo test?
01:00:47
Las de tipo test contarán eso, si están cuatro mal restan una bien y luego las de verdadero o falso, pues las de verdadero o falso todavía no estoy muy segura, pero yo creo que serán si hay dos mal restan una bien.
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De todas formas, eso os lo subo al aula virtual y así lo tenéis más claro.
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Cuando ya tenga un poco más pensado el examen, pues ya os lo pongo en el aula virtual.
01:01:21
Vale, vale, gracias.
01:01:34
Voy a detener la grabación.
01:01:37
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- S.A.
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- 14 de mayo de 2024 - 20:00
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